اولین استحکامات در این سایت برجی با پایه چهار گوش بود که بین سالهای 1583 و 1585 توسط معمار فلورانس کامیلو کامیلانی به دستور مارکانتونیو دوم کلونا نایب السلطنه جوان سیسیل به عنوان بخشی از نقشه دفاعی ساحل سیسیل ساخته شد. ساخت قلعه کنونی در سال 1615 توسط هرناندو پتیگنو فرمانده کل سواره نظام سلطنتی سیسیل و فرماندار نظامی سیراکوز شروع شد. برج قدیمی در قلعه جدید گنجانده شده است. ساخت و ساز تا سال 1636 قطع شد که کارها به کارگردانی سرپیون پنبه, مارکه دالتامورا. این قلعه در سال 1640 تکمیل و افتتاح شد و نمونه ای نادر از قلعه باروک است که چندین قلعه در قرن 17 در سیسیل ظهور کرد. فورت سانتانژلو هرگز مورد حمله قرار نگرفت و در قرن 19 غیرنظامی شد که از سال 1849 تا 1856 به عنوان مکانی برای تلگراف دولتی مورد استفاده قرار گرفت. در اوایل دهه 1900 قلعه توسط نیروی هوایی پادگان بود و قلعه فانوس دریایی شد. در صبح روز 10 جولای 1943 به اصطلاح دی روز برای فرود انگلیس و امریکا در سیسیل, فورت سانتانژلو توسط امریکایی رزمناو سبک یو اس اس بروکلین و ناوشکن یو اس اس باک بمباران شد. این باعث خسارت زیادی شد که بعدا همه جبران شد. در سال 1965 عملیات فانوس دریایی لغو شد و قلعه رها شد.
