मायकोनोसचे पुरातत्व संग्रहालय 1902 मध्ये उभारण्यात आले. हे संग्रहालय प्रामुख्याने 426-425 ईसापूर्व काळातील शुद्धिकरण खड्ड्यातून सापडलेल्या अवशेषांचे जतन करण्यासाठी स्थापन करण्यात आले होते. हा खड्डा 1898 मध्ये प्रसिद्ध विद्वान डी. स्टॅव्ह्रोपौलोस यांनी रेनियाच्या नयनरम्य बेटावरून शोधून काढला होता. प्रसिद्ध वास्तुविशारद, अलेक्झांड्रोस लाइकाकिस यांनी संग्रहालयाचे मोहक वास्तू वैशिष्ट्य डिझाइन केले होते. संग्रहालय असलेल्या इमारतीच्या बांधकामाची कल्पना शिक्षण मंत्रालयाने अथेन्सच्या पुरातत्व सोसायटीच्या सहकार्याने जन्माला आली.हेलेनिस्टिक कालखंडातील फुलदाण्यांचा संग्रह देखील त्यांच्या उपस्थितीने लक्षणीय आहे. संग्रहालयाच्या मुख्य आकर्षणांपैकी एक म्हणजे ट्रॉयच्या कॅप्चरमधील दृश्यांचे कुशलतेने चित्रण करणारे कलात्मकरित्या तयार केलेले पिथोस. 1961 मध्ये मायकोनोसमध्ये विहीर खोदत असताना हा उल्लेखनीय पिथोस सापडला.पिथोस कलात्मकरीत्या लाकडी घोड्यावरून ट्रोजन सैन्याच्या पतनाचे चित्रण करतात. पिथोसचे शरीर निष्पाप स्त्रिया आणि मुलांवर आक्रमण करत असलेल्या सैनिकांचे चित्रण करणारे फलकांनी बंद केलेले आहे. विद्वानांचा असा विश्वास आहे की पिथोस 7 व्या शतकापूर्वीचा आहे. येथे प्रचंड पुरातन अम्फोरा देखील आहे जो किचकट डिझाइन केलेल्या अलंकाराने सुस्पष्ट आहे. विशेष महत्त्व म्हणजे मानेवर स्फिंक्स आणि शरीरावर घोड्याचे डोके असलेली मूर्ती.ग्लायकॉनची ग्रेव्ह स्टील देखील त्याच्या उपस्थितीने स्पष्ट आहे जी योगायोगाने समुद्रात सापडली होती. पिडीत खडकावर बसलेला, मार्मिक आणि विचारशील मूडमध्ये जहाजाच्या प्रॉव्हच्या दिशेने रिकामेपणे पाहत आहे. पेडस्टलवर या शब्दांसह एक शिलालेख आहे ग्लायकॉन, प्रोटोजेनिसचा मुलगा, सद्गुणी, तुला चांगले. ही कबर स्टील संग्रहालयाच्या अमूल्य संग्रहांपैकी एक आहे.ग्लायकॉनच्या ग्रेव्ह स्टीलशिवाय, टर्टिया होरारियाची ग्रेव्ह स्टील देखील आहे. मृत महिला बसलेली दिसत आहे आणि समोर बसलेल्या तिच्या पतीकडे तिचा वियोगाचा हात पुढे करताना दिसत आहे. तिच्या मृत महिलेच्या दागिन्यांच्या कंटेनरसह गुलाम मुलाची प्रतिमा देखील आहे. रेनिया येथील प्रसिद्ध हेलेनिस्टिक स्मशानभूमीत हे ग्रेव्ह स्टेल संगमरवरी सारकोफॅगसच्या शीर्षस्थानी ठेवलेले होते आणि त्यावर टर्टिया होरारिया हे शिलालेख लिहिलेले होते. ते ख्रिस्तपूर्व दुसऱ्या शतकातील असल्याचे मानले जाते.रेनिया येथील हेरॅकल्सचा पुतळाही आहे. ही अमूल्य मूर्ती १८९९ मध्ये हेरॅकल्सच्या सुरक्षित स्वर्गात सापडली होती. शूर पुरुषाला नग्न चित्रित केले आहे आणि त्याच्या डाव्या हातात एक क्लब आणि सिंहाची कातडी आहे. ही उत्कृष्ट मूर्ती पॅरियन संगमरवराच्या उत्कृष्ट प्रकारापासून बनविली गेली आहे आणि ती दुसऱ्या शतकातील असल्याचे मानले जाते. मायकोनोसच्या थडग्यातून शोधण्यात आलेला आणि सायक्लॅडिक युगाच्या सुरुवातीच्या काळातील मानला जातो.सर्वात प्रसिद्ध संग्रहालयांपैकी एक म्हणजे आर्केइक हायड्रिया जी गुंतागुंतीच्या फुलांचा नमुना आणि घोड्यांच्या प्रतिमांनी सुशोभित केलेली आहे. शुध्दीकरण खड्ड्यातून सापडलेल्या अनेक फुलदाण्यांपैकी हे फक्त एक आहे. अप्रतिम लाल-आकृती हायड्रिया देखील पाहण्यालायक आहे आणि उडत्या नायकीच्या उंचीवरून स्पष्ट आहे. एक हरीण डाव्या बाजूने पळताना दिसत आहे.प्राचीन ग्रीक सभ्यता कलात्मक आकृत्यांना आकार देण्यासाठी चिकणमाती वापरण्यासाठी ओळखली जाते. मायकोनोसच्या पुरातत्व संग्रहालयात एका सुंदर स्त्रीची उत्कृष्ट मातीची मूर्ती प्रदर्शित करण्यात आली आहे ज्याचे चित्रण पारंपारिक चिटॉन आणि हिमेशन परिधान केलेले आहे. ही दुर्मिळ मातीची मूर्ती रेनिया येथे सापडली आणि ती दुसऱ्या शतकातील आहे. पारंपारिक पोशाख घातलेल्या मृत माणसाचा पुतळा देखील त्याच्या उपस्थितीने स्पष्ट आहे. सुंदर स्त्रीच्या मातीच्या मूर्तीप्रमाणे, मृत माणसाची ही मूर्ती देखील हेलेनिस्टिक रेनियाच्या परिसरातून शोधण्यात आली.