कब्रों को एस. फ्रांसेस्को के पूर्व चर्च के अंदर से स्थानांतरित किया गया था, जो अब बिना छत के एक विशाल खंडहर है, पोर्टिको में और 1659 में फिर से जोड़ा गया। जैसा कि आज प्रतीत होता है, पोर्टिको एक नव-गॉथिक पुनर्निर्माण का परिणाम है, जो पूरा हो गया है 1850 में इंजीनियर फ़िलिपो बंदिनी द्वारा। पाओला बियांका मालटेस्टी का मकबरा, जो पंडोल्फो III की पहली पत्नी थी, को मूर्तियों, अलमारियों, लटकते मेहराबों और मुड़े हुए स्तंभों से सजाया गया है, जिसमें अत्यधिक विस्तृत ताबूत के ढक्कन पर लेटी हुई मृतक की छवि है। यह मेस्ट्रो फ़िलिपो डी डोमेनिको द्वारा वेनिस से आयातित स्वर्गीय गोथिक मूर्तिकला की एक प्रामाणिक उत्कृष्ट कृति है। बोनेटो दा कास्टेलफ्रेंको का मकबरा अधिक विनम्र है, जिसे सिगिस्मोंडो मालटेस्टी ने अपने वफादार डॉक्टर के अवशेषों को रखने के लिए बनवाया था। पोर्टल के विपरीत दिशा में पंडोल्फो III मालटेस्टी के पुनर्जागरण मकबरे पर हावी है, जिसे उनके बेटे सिगिस्मोंडो ने चाहा था, जिन्होंने संभवतः लियोन बैटिस्टा अल्बर्टी को डिजाइन सौंपा था। हाल ही में पूरे स्मारकीय परिसर के जीर्णोद्धार के दौरान, पंडोल्फो III का ममीकृत शरीर अप्रत्याशित रूप से पाया गया था।
