एक ठाउँ को गहिरो पवित्रता, यो crypt थियो छान्नुभएको सेन्ट चार्ल्स Borromeo व्यक्तिगत रूपमा ठाँउ को प्रार्थना, उहाँले गए जहाँ हरेक बुधवार र शुक्रवार दिउँसो. यो असामान्य छैन, देख्न उहाँलाई खर्च सारा रात मा के उहाँले आफूलाई भनिन्छ "जिम पवित्र आत्मा मा", भक्तिको को simulacrum ख्रीष्टको चिहान. यस कारण लागि, पछि आफ्नो canonization, एक polychrome terracotta मुर्ति चित्रण सेन्ट अगाडि kneeling sarcophagus राखिएको थियो.
यो crypt पनि अनुमति दिन्छ आगंतुकों संग संपर्क मा प्राप्त सबैभन्दा पुरानो करार को इतिहास मा शहर । यो फर्श, मिलेर ठूलो slabs को सेतो पत्थर 'को वर्नान' आउँछ, वास्तवमा देखि फर्श को प्राचीन रोमन फोरम को चौथो शताब्दीमा, मुख्य वर्ग को रोमन civitas, जहाँ प्रमुख नागरिक र धार्मिक गतिविधिहरु भयो ।
पुन पछि सार्वजनिक पचास वर्ष 2016 मा, त्यसपछि, यो crypt विषय थियो एक जटिल पुनर्स्थापना सञ्चालन द्वारा financed MIBAC र मा समाप्त लेट वसन्त 2019 को उद्देश्य मुख्यतः मा पुन को सजाया सुनेर । धन्यवाद पुनर्स्थापना, वास्तवमा, अद्भुत frescoes र सजावट have resurfaced जस्तै, सजावटी चक्र संग तारा र वनस्पति तत्व मा वाल्टों को presbytery, डेटिङ अन्त गर्न को तेह्रौँ शताब्दीमा. पुनःस्थापित गरिएको छ, पनि दुई सुन्दर र तीव्र crucifixions (एक मात्रा मा, बन्द प्राप्त, अन्य चौधौँ शताब्दीका मा presbytery), तीन गणनामा तथ्याङ्कले को मरियम मग्दलिनी, यूहन्ना बप्तिस्मा दिने र सेन्ट. हेलेना, आमा Constantine (वा सायद सान्ता Caterina d'alessandria), यो खाना मा शिमोनको घर को बाँया भाग को presbytery, यो frescoes को Madonna को Loreto र Madonna र संन्यासी Rocco र यूहन्नाले बप्तिस्मा लबी मा र प्लास्टर र सजावट को सत्रौँ शताब्दीको मा, यो apse, चित्रण संग साधन को आवेग.