रोक्का पाओलिना आज पेरुगिया के भीतर एक वास्तविक "शहर के भीतर शहर" है। इसका निर्माण पोप पॉल III फ़ार्नीज़ की इच्छा से किया गया था, जिसका उद्देश्य पेरुगिया को उसके निवासियों की इच्छा के विरुद्ध चर्च के राज्य में शामिल करने के लिए शहर पर विजय प्राप्त करने के बाद एक किलेदार गढ़ में बदलना था। अपने गढ़ का निर्माण करने के लिए, पोप पॉल III ने सैकड़ों घरों, चर्चों और मठों को ध्वस्त कर दिया, जिससे पेरुगियों की कभी न खत्म होने वाली नफरत अर्जित हुई, जिन्होंने सदियों से एक से अधिक बार रोक्का पर हमला किया और उसे नुकसान पहुंचाया। अंततः, 300 से अधिक वर्षों की (बहुत अधिक नहीं) सम्मानजनक सेवा के बाद, 1860 में किलेबंदी को नष्ट कर दिया गया।पूरे किले के केवल छोटे टुकड़े ही आज बचे हैं जिनका उपयोग अक्सर सांस्कृतिक कार्यक्रमों और बाजारों की मेजबानी के लिए किया जाता है और जिनमें अभी भी बगलियोनी परिवार के प्राचीन घर शामिल हैं। बाद वाले पोप पॉल III के कट्टर दुश्मन थे और पोप द्वारा नष्ट किए गए कई पड़ोस और इमारतें इसी परिवार की थीं। एक जिज्ञासा: पोर्टा मार्ज़िया, शहर के सबसे पुराने द्वारों में से एक, इट्रस्केन काल का है, लेकिन मूल रूप से यह उस स्थान पर स्थित नहीं था जहां यह आज है। जब उन्हें रोक्का पाओलिना की दीवारों के भीतर इसे शामिल करने का आदेश दिया गया, तो वास्तुकार एंटोनियो दा सांगालो द यंगर ने इसे सचमुच में ध्वस्त कर दिया और चार मीटर आगे फिर से जोड़ा, ताकि इसे नई दीवारों के लेआउट में पूरी तरह से सम्मिलित किया जा सके।