การเข้าพักในเมืองหลวงของมอลตาจะไม่สมบูรณ์หากไม่ได้ไปเยือนมหาวิหารร่วมเซนต์จอห์นในมอลตา โครงการนี้ได้รับมอบหมายจากปรมาจารย์ Jean de la Cassiere ในปี 1572 เพื่อใช้เป็นโบสถ์สำหรับคณะอัศวินแห่งเซนต์จอห์น และออกแบบโดย Gerolamo Cassar สถาปนิกชาวมอลตา งานนี้เสร็จสมบูรณ์ในปี ค.ศ. 1577 และอุทิศให้กับ St. John the Baptist ซึ่งเป็นหนึ่งในสองนักบุญอุปถัมภ์ของคณะ มหาวิหารร่วมเซนต์จอห์นในวัลเลตตาแสดงถึงความสำคัญของศาสนาคริสต์ต่อประเทศมอลตา จากภายนอก อาสนวิหารในศตวรรษที่ 16 แห่งนี้อาจดูเหมือนไม่มากนัก แต่ลองมองเข้าไปข้างในแล้วคุณจะพบกับความประหลาดใจอย่างแท้จริง อาสนวิหารได้รับการปรับปรุงใหม่ในศตวรรษที่ 17 และมีการตกแต่งแบบบาโรกที่หรูหรา นอกเหนือจากศิลปะบาโรกและโบราณวัตถุที่เข้มข้นแล้ว วิหาร Co ยังมีจิตรกรรมฝาผนังสไตล์บาโรกที่น่าประทับใจ พื้นหินอ่อนที่หรูหรา รูปปั้นสามมิติ ผนังหินแกะสลัก มหาวิหารร่วมยังเป็นที่ตั้งของหนึ่งในผลงานที่ได้รับการยอมรับในระดับสากลมากที่สุดโดย Michelangelo Merisi da Caravaggio หรือที่รู้จักกันในชื่อ ‘การตัดศีรษะของนักบุญยอห์นผู้ให้บัพติศมา’ (1608). ภาพวาดที่ตั้งอยู่ภายใน Oratory เป็นผลงานศิลปะที่ใหญ่ที่สุดของคาราวัจโจและเป็นคนเดียวที่มีลายเซ็นของเขา ทุกวันตลอดทั้งปี ผู้เข้าชมจะเดินทางมาที่มหาวิหารเพื่อชมผลงานศิลปะที่มีชื่อเสียง และหลายคนจะกลับมาที่มหาวิหารทุกครั้งที่อยู่บนเกาะ ตัววิหารประกอบด้วยโบสถ์น้อยเก้าหลังที่ตกแต่งอย่างสวยงามทั้งสองด้าน แปดถูกสร้างขึ้นสำหรับแต่ละภาษาของอัศวินแห่งเซนต์จอห์นและที่เก้าอุทิศให้กับนักบุญอุปถัมภ์ของพวกเขา Our Lady of Philermos ซึ่งเป็นนักบุญองค์อุปถัมภ์อื่น ๆ ของภาคี โบสถ์หลังสุดท้ายยังเป็นที่ประดิษฐานรูปเคารพโบราณของสุภาพสตรีแห่งฟิแลร์มอส ซึ่งเหล่าอัศวินถือว่าเป็นวัตถุศักดิ์สิทธิ์ มหาวิหารร่วมเซนต์จอห์น มอลตายังมีห้องใต้ดินลึกลับที่บรรจุหลุมฝังศพของปรมาจารย์ในอดีตของอัศวินแห่งเซนต์จอห์น
