ჰონკონგი ისტორიის მუზეუმი დაარსდა ივლისი 1975 როდესაც ქალაქის მუზეუმი და ხელოვნების გალერეა გაიყო ჰონკონგი ისტორიის მუზეუმი და ჰონკონგი ხელოვნების მუზეუმი. მაგრამ ზოგიერთი მუზეუმის კოლექციების თარიღდება ქალაქის მუზეუმი და ხელოვნების გალერეა დაარსდა 1962 წელს მერიის. 1983 წელს, მუზეუმი გადავიდა დროებითი საცხოვრებელი Kowloon Park. იგი გადავიდა მისი დღევანდელი შენობაში Chatham Road South, Tsim Sha Tsui in 1998. მუდმივი სახლში ჰონკონგი ისტორიის მუზეუმი, მთლიანი ფართობით 17,500 მ 2, განთავსდა ახალ შენობაში საფუძველზე არქიტექტურული კონცეფცია Mr E. Verner Johnson. ახალი მუზეუმი და მეზობელ მეცნიერების მუზეუმი ერთად ქმნიან სამუზეუმო კომპლექსი ჰარმონიული გამოჩენა და ფერი სქემა.