シタデル内部では、モハメド・アリのハレム宮殿も見学できます。マニアルにあるムハンマド・アリ王子の宮殿博物館は、エジプトで最も美しく、重要な歴史博物館のひとつです。この博物館は、近代エジプトの歴史における重要な時代を展示しており、その建築デザインが特徴的です。その近代的なイスラム様式は、ペルシャやマムルーク朝の要素と融合している。また、シリア、モロッコ、アンダルシアのモチーフや、オスマントルコのスタイルからもインスピレーションを受けています。このように、この建物は数多くのイスラム建築の伝統の間で調和しているのです。
ムハンマド・アリ・タウフィク皇太子の宮殿は、1319年から1348年(西暦1900年から1929年)の間に建てられ、宮殿の入り口を囲む外壁で構成されています。壁の内側には、宮殿を囲む素晴らしい庭園に加えて、レセプション・エリア、時計塔、サビル、モスク、狩猟博物館、居住区、王座ホール、個人博物館、黄金のホールがあります。 レセプション・パレスは、宮殿に入って最初に目に入るものです。タイル、シャンデリア、天井彫刻などで豪華に飾られた大広間は、フランスの有名な作曲家カミーユ・サン=サーンスのような格式の高いゲストを迎えるために作られたもので、彼はこの宮殿でプライベートコンサートを開き、ピアノ協奏曲No.レセプション・ホールには、貴重な骨董品が展示されている。レセプションホールには、絨毯や家具、アラブの装飾が施されたテーブルなど、貴重なアンティークが展示されています。王子は、宮殿や博物館に展示するために、貴重な美術品を探して持ち込むチームを編成していたと言われている。
宮殿は2階建てになっている。1階には政治家や大使を迎えるための名誉の間と、毎週金曜日の礼拝の前に上級礼拝者が王子と一緒に座るためのレセプション・ホールがあり、上部には2つの大きなホールがあり、1つはその壁が鏡やファイアンスのタイルで覆われたモロッコ風のデザイン、もう1つはレバノン風のデザインで、壁はコーランの文章や詩が書かれたカラフルな幾何学や花をモチーフにした木材で覆われています。
レジデンシャル・パレスも同様に素晴らしいもので、そこにある最も精巧な作品のひとつは、王子の母親が所有していた850キロの純銀でできたベッドである。これはメインの宮殿で、最初に建てられた建物です。梯子でつながった2階建て。1階には、噴水のあるロビー、ハラムリク、鏡の間、青のサロン、貝のサロン、シェクマ、食堂、暖炉の間、王子の執務室と書斎がある。最も興味深いのは「青の間」で、青いファイアンス・タイルで飾られた壁に革張りのソファが置かれ、オリエンタルな油絵が飾られています。
その後、王座の宮殿があり、その美しさは目を見張るものがあります。2階建てで、下の階は「玉座の間」と呼ばれ、その天井には金色の光線が部屋の四隅に伸びる太陽の円盤が描かれている。ソファーや椅子にはベロアが張られ、モハメド・アリ一族のエジプト支配者たちの大きな絵や、エジプト各地の風景画が並べられている。休日などに王子が賓客を迎えたのもこの部屋でした。上階は、冬期用の2つの広間と、壁面がすべてフランスのオーブソンの生地で覆われていることから「オーブソンの間」と呼ばれる珍しい部屋から成っています。これは、モハメド・アリ皇太子の母方の祖父であるイリハミ・パシャのコレクションに捧げられたものです。
もうひとつの大きな部屋は、壁も天井もすべて金で装飾されていることからその名がついた「黄金の間」で、骨董品はないものの、公式の祝宴に使用されたそうです。おそらくこれは、その壁と天井が金色の花や幾何学的なモチーフの彫刻で覆われていることから説明できるだろう。モハメド・アリ王子は、実はこの広間を祖父のイルハミ・パシャの家から移築したもので、もともとはクリミア戦争でロシア帝国に勝利したイルハミ・パシャを称えるために出席したスルタン・アブドゥル・マジッド1世を迎えるために建てられたものである。
宮殿に付属するモスクは、ロココ調の天井と青いセラミックタイルで飾られたミフラーブ(龕)があり、右側には金色の装飾が施された小さなミンバル(説教壇)があります。陶芸作品は、クタヒヤ出身のアルメニア人陶芸家ダヴィッド・オハネシアンによるものです。モスクには2つのイワンがあり、東側のイワンの天井は小さな黄色いガラスのドームの形をしており、西側のイワンは日輪の装飾が施されています。
時計塔は、レセプションホールとモスクの間にあります。夜間は火、昼間は煙によって観測し、メッセージを送るために使われたアンダルシアとモロッコの塔の様式を統合し、上部に時計を置き、その針は2匹の蛇の形をしている。塔の下部には、宮殿の他の多くの部分と同様に、コーランの経典が描かれています。
宮殿のデザインは、ヨーロッパのアールヌーボーやロココと、マムルーク、オスマン、モロッコ、アンダルシア、ペルシャといった伝統的なイスラム建築の様式が融合している。 王族時代、モハメド・アリ皇太子はここで国のトップパシャや大臣、高官、作家、ジャーナリストを招いて多くのパーティーや会議を開催した。王子は自分の死後、この宮殿を博物館にすることを希望した。
1952年の革命後、モハメド・アリ・パシャの子孫の財産は差し押さえられ、宮殿は博物館として生まれ変わり、国民はようやく王族が暮らした壮麗な姿を自分の目で見ることができるようになったのである。