该博物馆于2001年由Carlo Maria Martini红衣主教于2017年命名，是一个重要项目的到达点，二十世纪米兰大主教的一些最伟大的人物已经做出了决定性的贡献。 它的起源可以追溯到1931年有福的Ildefonso Schuster的第一个直觉，然后在1960年由红衣主教Montini接管，这表明作为新博物馆的所在地Sant'eustorgio修道院，这是安布罗西亚基督教历史的关键地点之一。 最后，红衣主教马提尼，在八十年代，被委托给Belgiojoso工作室开始修道院的重建工作，受到第二次世界大战轰炸严重破坏的艰巨任务。米兰的第一个多米尼加修道院位于这里，从十三世纪开始，两个修道院，圣尤斯托吉奥大教堂博物馆和教区博物馆都位于这里，是那个古老的修道院的遗存。
教区博物馆的永久收藏，占据了第二个修道院，由二世和二十一世纪之间的一千多件作品组成。 从大主教的办公室来了米兰大主教的收藏（蒙蒂，维斯康蒂，里卡迪，波佐波内利收藏的一部分，以及完整的埃尔巴Odescalchi收藏）。
除了教区教堂的绘画之外，博物馆还保留了一批重要的礼仪家具作品。 该系列由致力于黄金基金的部分完成（十四和十五世纪的作品，主要是托斯卡纳，由Alberto Crespi教授收集并捐赠给博物馆），以及Caterina Marcenaro收藏的雕塑和绘画，Sozzani收藏的图纸和珍贵的舒伯特遗产。
最后，卢西奥*丰塔纳的雕塑作品的第一个核心，增加了XX和XXI世纪的众多作品，这是博物馆对当代性越来越感兴趣的宣言。
