Ο τάφος του Αγίου Clare σχεδιάστηκε και ήθελε έξω από την porta urbica, στην εκκλησία του San Giorgio, όπου ο Francis ήταν ήδη προσωρινά θαμμένος και όπου ο άγιος θάφτηκε στις 12 Αυγούστου 1253. Η Εκκλησία του San Giorgio βρισκόταν λίγο έξω από την ομώνυμη πύλη της πόλης, λίγο πιο κάτω από το δρόμο που, φεύγοντας από την πόλη, κατευθυνόταν "versus Ispellum". ένας άλλος δρόμος ανέβηκε στο san Rufino και ένας τρίτος, κατά μήκος του ρωμαϊκού τείχους, κατέβηκε προς την porta Moiano. Ως εκ τούτου ο τόπος ονομάστηκε "Tribium s.Georgii". Μεταξύ του δρόμου και της εκκλησίας βρισκόταν, πριν από λίγο καιρό, ένα νοσοκομείο προσαρτημένο στην εκκλησία.όλα εξαρτώνταν από το κεφάλαιο του καθεδρικού ναού.
Ενώ για την εκκλησία-μαυσωλείο, που θα ανεγερθεί προς τιμήν του Αγίου Φραγκίσκου, ο τόπος καθορίστηκε μόλις δύο χρόνια μετά το θάνατό του, για εκείνη που θα αφιερωθεί στην Αγία Κλερ προσανατολίσαμε αμέσως προς το αντίθετο τμήμα της πόλης, ακριβώς δίπλα στην εκκλησία του Αγίου Γεωργίου (Μαρίνο Μπιγκαρόνι, η Βασιλική του Αγίου Κλερ στην Ασίζη, σ.13). Τρία χρόνια μετά το θάνατο και ένα χρόνο μετά την αγιοποίηση του Αγίου Clare ξεκίνησε το 1257 η κατασκευή της Βασιλικής του Αγίου Clare γύρω από την αρχαία εκκλησία του Αγίου Γεωργίου, η οποία μέχρι το 1230 είχε κρατήσει τα θνητά λείψανα του Αγίου Φραγκίσκου. Τα ερείπια του αγίου μεταφέρθηκαν ήδη το 1260, ενώ η Πανηγυρική εκδήλωση πραγματοποιήθηκε το 1265, παρουσία του Κλήμεντος IV. οι εργασίες κατασκευής πραγματοποιήθηκαν από τον αρχιτέκτονα Filippo Da Campello. Η κρύπτη που στεγάζει τώρα τον τάφο του Αγίου χτίστηκε μόλις το 1850.
