המנזר הבנדיקטיני העתיק של פומפוסה כולל כיום את הבזיליקה עם האטריום, מגדל הפעמונים הרומנסקי, אולם הפרק, אולם קביים, חדר האוכל, חדר האוכל, המעונות ופלאצו דלה רגונה. מבנים אלה שוכנו בימי הביניים מרכז הרוחניות והתרבות בין החשובים ביותר בעולם. אירועי אקלים נוחים אפשרו בין המאה ה-6 למאה ה-7. ההתיישבות של קבוצה של נזירים בנדיקטינים מרוונה, שבחרו אי בין ה-Po והים כי לשימוש ברוגע העדיף מדיטציה ועבודה קשה.
החדשות הראשונות שנכתבו על פומפוסה הן משנת 874 והן נוגעות במחלוקת שיפוטית בין הבישוף של רוונה לאפיפיורות. במהלך המאה הבאה ערך המנזר החיוני את עצמאותו מהמושיע הקדוש מפביה ורובנה, אשר התרחש בשנת 1001, הודות להסכם שנחתם על ידי הקיסר אוטו השלישי והאפיפיור סילבסטר השני.
תרומות והזכויות מגדילות את כוחה הכלכלי של פומפיי אפילו באזורים הסמוכים של ונטו ורומאניה. בתחילת המאה ה-14. למנזר פומפוסה הייתה סמכות שיפוט על 49 כנסיות מפוזרות ברחבי צפון-מרכז איטליה. עם הופעתו של מנזר סן גווידו דגלי ג ' רמביאטי לראש מנזר פומפוסה (1008-1046) מתחילה התקופה הפורה ביותר במנזר הבנדיקטיני, אשר יבוקרו מאוחר יותר על ידי דמויות חשובות, כמו סן פייר דמיאלאני ואליגיירי. באותה תקופה, היה זה הנזיר גווידו d " ארצו לו הגיע הזמן ו-quot; ההמצאה ו-quot; של תווים מוזיקליים. מאוד מפורסם היה גם הספרייה העשירה של המנזר, אשר ראתה כאן לפרוח קלאסי, ספרותי, לימודי דת, ולאחר מכן ללכת פיזור בלתי הפיך. הפלאצו דלה רגונה (Palazzo della Ragione), שנבנה מעט הרחק מהמתחם המונסטי, הוא עדות לפעולת הצדק של ראש המנזר בשטחים שמתחת למנזר.
במאות השנים של תפארתו של המנזר שגשגו האמנויות האדריכליות והצילומים, שהשאירו אותנו מעל כל המחזורים הנפלאים של המאה ה-14 של הבזיליקה, המצלול ואולם הפרק. לאחר מכן, בעקבות אירועים קטסטרופליים, שהגיעו לשיאם בדרך Po שנקראה Fictarolo, שתחילתה עד 1152, האינטרס הכלכלי והתרבותי עוזב את אזור החוף, עכשיו פלש על ידי מים, והנזירים לעזוב פומפוזה למנזר החדש של S. Benedetto di Ferara (1553).
אחזרתו של המנזר של פומפוסה יושמה לאחר מכן מסוף שנת 800, כאשר כל הבניינים נרכשו על ידי האחוזה והוחזרו לחיים חדשים. לבסוף, המוזיאון נוסד בשנת 1976, אשר אוסף, בחדר הגדול של מעונות הנזירים, שרידי פיסול, ציורים ויצירות אמנות אחרות הקשורות להיסטוריה של המנזר.
