ציורי הקיר המקשטים את קריפטה של אפיפניוס הם בין הדוגמאות החשובות ביותר לציור אירופאי מוקדמים של ימי הביניים, בשל האיכות הטכנית והצורנית, המורכבות של הנושאים המתוארים ומצב השימור המצוין.הייצוגים מתחילים בדימוי של יד מושטת, מעל חלון הזרוע הצפונית, סמל של ידו של האב הנצחי הרומז למקורו העל טבעי של האור, כלי לגילוי האמת. החומה המזרחית מספרת את התגלמות המילה במשיח, חידוש הברית עם האדם המאפשרת את ישועתו (הבשורה; הריונה של מרים; המולד; רחיצת ישו; הצליבה, שתחתיה מתואר אב המנזר אפיפניו). ביקור ה-Pie Donne בקבר הקדוש וישו, סן לורנצו וסנטו סטפנו בתוך גומחה). בצד ימין של הזרוע המזרחית מופיעה ייצוגה של מריה רג'ינה יושבת על כס המלכות, לבושה כקיסרית ביזנטית. היא מחזיקה בזרועותיה את ישוע התינוק אוחזת במגילת החוק המחדשת את ברית הברית בין אלוהים לאדם. לרגלי הדמויות דיוקנאות של דמויות לא מזוהותעל הקיר המערבי, לעומת זאת, מסופרת עדותם של אלה שבחרו להאמין בישוע על ידי קבלת מות הקדושים. קבוצת הייצוגים מתחילה בירידתו של ישו אל לימבו, מצוירת על הכספת מעל הכניסה, ואחריה, על הקיר, תאוריה של קדושות בפעולה להציע למשיח את כתר התכשיטים, סמל מות הקדושים שלהן ומעל. מעבר לאפסיס המרכזי, העינויים של סן לורנצו וסנטו סטפנו, מופרדים על ידי גומחה עם תיאור של דיאקון בתפילה.הנרטיב מגיע לשיאו באפסיס שבו מתוארים כמה מרכיבים מהחזיונות של יוחנן האוונגליסט ומדווחים בספר ההתגלות (ארבעת המלאכים בארבע פינות כדור הארץ כדי לעצור את הרוחות והמלאך החמישי, אולי המשיח עצמו, העולה מהמזרח עם חותמו של אלוהים חיים). מעל דמות המלאך החמישי נמצאת שוב מריה רג'ינה, יושבת על כס מלכות, בידיה ספר פתוח ובו הפסוקים הראשונים של ה"מגניפיקט" שבו היא מודה לאלוהים על אמהותה המופלאה. עמדתה יכולה לרמוז לתפקיד המתווך בין אלוהים השופט לאנושות. מתחת לרגליו של המלאך החמישי יש גם עקבות של דמות קטנה הכורעת, שאותיות הכתובת ששרדו מאפשרות לנו לזהות עם בישוף "אפיסק[אופוס]", הממונה הסביר על העבודות. לבסוף, דמותו של ישו פנטוקרטור היא מרכזית בנקודה שבה הזרועות מצטלבות.הרצועה הדקורטיבית העוברת לאורך החלק התחתון של הקירות משחזרת את המוטיבים של הבדים ששימשו לתלייה על קירות הכנסיות; בפרט, מול הכניסה, מתואר קשר אפוטרופי ששימש להדוף את כוחות הרשע. לבסוף, באפסיס משוכפלים שקנאים שבסמליות הנוצרית הם מטפורה של ישו המקריב את עצמו בסעודה האחרונה, כי כדי להאכיל את צעיריהם הם קורעים את עורם על ידי הקרבת דמם.
