A Igreja de San Giovanni Battista é um dos mais belos e mais preservados exemplos do Estilo Românico Apuliano presente em Matera. A estrutura original remonta a anos imediatamente antes do século XII e foi concluída em 1233, neste período A Igreja era conhecida como Santa Maria la Nova e foi um lugar de recepção para os penitentes Agostinianos de aconte. Quando as freiras se mudaram, por volta do final do século XV, a igreja foi abandonada e permaneceu sem uso até 1695 ano em que Monsenhor Del Ryos sancionou a sua reabertura ao culto, dando-lhe o nome pelo qual a conhecemos hoje. Ele é acessado através do que era originalmente a fachada lateral, a principal foi incorporada em 1610 na construção do edifício adjacente que era para executar a função de nosocomio. O Portal finamente decorado, uma janela de rosas adornada com ornamentos refinados e uma estátua de São João Batista feita de pedra policromada destacam-se. À direita do portal, a fachada correspondente à abside tem uma estrutura muito próxima da original. O elemento que mais caracteriza esta igreja é a arquitetura interna tipicamente medieval, é possível admirá-la graças à iniciativa do Abade Marcello Morelli que, entre 1920 e 1930, decidiu eliminar a capa do século XVIII. A igreja tem uma cruz latina e consiste de 3 Naves divididas por pilares quadrilobados; sobre elas estão semi-colunas e capitais que têm decorações muito elaboradas e extremamente variadas. A partir dos pilares desenvolver grandes arcos que formam cofres cruzados.
