Az állatkerti állomás alapítását 1872 márciusára datálják. Anton Dohrn, az alapító és első igazgató 1840-ben született a ma Lengyelországhoz tartozó Pomerániában, Szczecinben, jómódú polgári családban. Dohrn különböző német egyetemeken zoológiát és orvostudományt tanult, de nem sok lelkesedéssel. Ideáljai 1862 nyarán változtak meg, amikor Jénába került, és ott találkozott Ernst Haeckellel, aki megismertette Charles Darwin műveivel és elméleteivel. Dohrn lelkes védelmezőjévé vált Darwin "a módosulással történő leszármazás" elméletének, a természetes kiválasztódás útján történő evolúció elméletének. Ezután elhatározta, hogy életét a darwinizmust alátámasztó tények és eszmék gyűjtésének szenteli, és ez lett egy életre szóló kaland kiindulópontja. Egyetemi pályafutása alatt a tengerparton töltött kutatási időszakokat: Helgolandon, Hamburgban, a skóciai Millportban és Messinában. Itt alakult ki az a terv, hogy a világot a vasútállomásokhoz hasonló biológiai kutatóállomások hálózatával fedjék le, ahol a tudósok megállhatnak, anyagot gyűjthetnek, megfigyeléseket és kísérleteket végezhetnek, mielőtt továbbállnak a következő állomásra.A sok nehézséggel szembesülve Dohrn arról kezdett fantáziálni, hogy a tengerbiológusok a tengerre érkezve egy kész munkaasztalt találnak, laboratóriummal, felszereléssel, vegyszerekkel, folyóiratokkal és könyvekkel, valamint információkkal arról, hogy bizonyos fajok hol és mikor találhatók meg, továbbá hasznos információkkal a helyi tengeri viszonyokról, tengerfenékről és partvonalakról. Miután megkísérelte projektjét Messinában, Dohrn úgy döntött, hogy Nápoly lenne az ideális hely az állomásának. A választás a Földközi-tenger nagy biológiai gazdagsága miatt esett erre a városra, valamint azért, mert egy nemzetközi jelentőségű kutatóintézet kialakításának lehetőségét egy olyan városban kínálta, amely maga is nemzetközi jelentőségű és nagy kiterjedésű. A berlini akváriumban tett látogatása után, amelyet éppen akkor nyitottak meg, úgy gondolta, hogy egy nyilvános akvárium elég pénzt tudna keresni ahhoz, hogy a laboratóriumok állandó asszisztensét ki tudja fizetni. Nápoly a maga 500 000 lakosával Európa egyik legnagyobb és legvonzóbb városa volt, nagy turistaáradattal (évi 30 000), az akvárium potenciális látogatóival.A képzelőerő, az akaraterő, a diplomáciai képességek és egy jó adag szerencse ötvözésével, valamint a tudósok, művészek és zenészek baráti támogatásával Anton Dohrn legyőzte a kételyeket, a tudatlanságot és a félreértéseket, és sikerült meggyőznie a városi hatóságokat, hogy ingyenesen adjanak neki egy darab földet a tengerparton, a gyönyörű Villa Comunale-ban, az akkori Királyi Parkban. A maga részéről megígérte, hogy saját költségén megépíti az állatkerti állomást. Dohrn pontosan tudta, mit és hogyan akar, és maga készítette el az építkezés terveit. Az alapokat 1872 márciusában rakták le, és 1873 szeptemberére az épület elkészült. Az első épület, jelenleg a központi rész után 1885-1888-ban egy második épületet építettek, amelyet egy híd kötött össze az elsővel, míg az udvar és a nyugati rész 1905-ben épült meg. Alig ötven évvel később az első és a második épület közé illesztették be a könyvtárat.Az 527 négyzetméter alapterületű nyilvános akváriumot 1874. január 26-án nyitották meg, és a mai napig egyedülálló, mivel létrehozása óta alig változott; ez a legrégebbi, még mindig működő 19. századi akvárium, és az egyetlen, amely kizárólag a Földközi-tenger állat- és növényvilágával foglalkozik. William Alford Lloyd angol mérnök felügyelete alatt épült, aki már a hamburgi és londoni nyilvános akváriumok tervezésében is közreműködött.Az Állatkerti Állomás hivatalos megnyitására 1875. április 14-én került sor.A legújabb szervezetszociológiai tanulmányok szerint a Zoológiai Állomás az ipari korszak csúcsán a tudományos kutatás tervezésének posztindusztriális modelljét vetítette előre, amely olyan tipikusan korabeli témákat részesített előnyben, mint az interdiszciplinaritás, az önfinanszírozás menedzsmentképessége (az akvárium és a tengeri állatok más kutatóintézeteknek történő értékesítése stb. révén), valamint a kutatásban részt vevők (munkatársak, technikusok, halászok és rendészek) együttműködésének és együttműködésének előmozdítása. Laboratóriumaiban nem kevesebb, mint 19 Nobel-díjas dolgozott aktívan, jelentős lendületet adva a biológiai tudományok fejlődésének.