Complexul religios a fost construit pe ruinele unei biserici ridicate în 1580 în cinstea Sfintei Fecioare din Porto Salvo. Această construcție originală fusese demolată aproximativ două sute de ani mai târziu pentru a face loc șantierelor navale din Castellammare di Stabia. Datorită proprietăților sale, apa Madonei își păstrează neschimbate în timp caracteristicile organoleptice, motiv pentru care era folosită în trecut de marinarii care se pregăteau să se îmbarce în călătorii lungi, luând-o direct de la izvorul care dădea și el spre mare. Tocmai datorită utilizării sale, era numită și apa marinarilor.În 2014, robinetele pentru apa Madonei și apa acidulată au fost închise timp de câteva luni din cauza numeroaselor rapoarte privind reziduurile poluante găsite în fântânile de pe Via Duilio. În urma analizelor și a lucrărilor de întreținere comandate de municipalitate la conducte, a fost din nou posibilă utilizarea acestor ape speciale, considerate în continuare printre cele mai sănătoase din lume.