Skapat på 70-talet i syfte att samla in och ställa ut för allmänheten de många fynden från utgrävningarna av Egnazia, är den uppdelad i kronologiska sektioner och dokumenterar bosättningens historia från sitt ursprung fram till dess nedgång.Av särskilt intresse är exemplen på trozzella, en typisk kruka av den messapiska kulturen som kännetecknas av plasthjul – kallad "trozze"- applicerad på handtagen. Bredvid den fina apule keramik med röda figurer, det finns många vaser "Gnathia stil", i svart färg med överlappande dekoration i vitt och gult, utbredd i hela Puglia.
Amforan, liksom det stora utbudet av artefakter, ursprung italienska, afrikanska och östra, vittnar om vikten av handel, vilket ökade tack vare byggandet av hamnen och via Traiana.Den vackra huvudet av Attis med den typiska phrygian cap, som tillhör en staty av Hadrianus ålder och huggen i vit marmor, är ett vittnesbörd om spridningen av kulten av ursprung öster om den stora Moder gudarna Cybele.
