Verdadero centro primitivo del franciscanismo, la Porciúncula se convirtió en uno de los lugares de peregrinación más importantes, hasta el punto de que el Papa Pío V, al final del Concilio de Trento, decidió hacer construir esta grandiosa basílica con el fin de dar nueva vida a la Orden de los Hermanos Menores y una acogida adecuada a los numerosos fieles que ya visitaban la Porciúncula. La iglesia, de tres naves, con transepto no saliente, planta de cúpula cruzada y ábside semicircular, fue diseñada por Galeazzo Alessi; se completó en 1679 con la construcción del campanario de la derecha, que debía coincidir con el de la izquierda, que termina justo encima del tejado de la iglesia . Los terremotos de 1832 provocaron el derrumbe de la nave central hasta la bóveda de crucería, tramos de las laterales y la parte superior de la fachada, mientras que la cúpula y el ábside se salvaron. El foco de la basílica, es decir, la capilla de la Porciúncula aparece como una pequeña iglesia, directamente bajo la cúpula. A principios del siglo XIII, la iglesia había sido abandonada entre las encinas de los monjes benedictinos de Subasio. Hacia 1205, Francisco estableció allí su hogar, restauró la iglesia y fundó la Orden Franciscana. Alrededor de la Porciúncula se construyeron las primeras cabañas para los monjes, hechas de arcilla y cañas. Este fue el lugar donde San Francisco vivió más a menudo, donde dio a Santa Clara su hábito religioso (1212) y donde celebró el Capítulo de las Esteras (1221), al que asistieron más de 5000 frailes. La tradición afirma que aquí San Francisco obtuvo la indulgencia plenaria de la Virgen María. La Porciúncula es una construcción rectangular muy sencilla, realizada en piedra policromada de Subasio. La parte superior de la fachada está cubierta por un fresco (El Perdón de Asís), obra de Friedrich Overbeck de Lübeck (1829). En el lado derecho se encuentran los restos de dos frescos del siglo XV de influencia sienesa: La Virgen con el Niño entre San Francisco y San Bernardino. En la parte posterior, un fresco de Perugino, El Calvario (cuya parte superior se ha perdido). El interior (las aldabas de la puerta son del siglo XV) tiene una bóveda de crucería, un poco ennegrecida por el humo de las lámparas; en el altar, la Anunciación y las historias del Perdón, un gran panel de Ilario da Viterbo (1393), que también realizó la franja pintada al fresco en la bóveda con los Evangelistas; en la pared de la izquierda hay un fresco de la Imago Pietatis.