Basilikan S. Eufemia ligger inuti Ärkebiskopens palats, vars område ockuperades av Lombard Dukes bostad,som dokumenten från VIII och IX-talen återkallar. De första nyheterna om Klostret S. Eufemia och den bifogade kyrkan går tillbaka till det tionde århundradet, då abbedissan i Klostret S. Eufemia bad Benediktinmunken Giovanni Cassinese att skriva livet för S. Giovanni ärkebiskop av Spoleto. I mitten av det tolfte århundradet användes komplexet som biskopspalats, förmodligen efter utbyggnaden av katedralen som involverade användningen av det område som ockuperades av biskoparnas gamla bostad. Mot slutet av det fjortonde århundradet, fick i uppdrag att en blygsam målare att skildra komplexet av biskopens palats; han har lämnat oss, i lokaler gamla kansliet, en ögonblicksbild av komplexet och S. Eufemia innan de började det stora byggnadsarbetet på byggnadens struktur. I mitten av 1500-talet styrdes stiftet spoleto av patriarken av Alexandria, den venetianska Marco Condulmer, och vid ungefär den tiden verkar kyrkan ha ändrat den gamla titeln S. Eufemia, eller Johannes ärkebiskop i St Lucia, och gjordes för triptyken för det höga altaret, som nu bevarades i Stiftsmuseet. I slutet av femtonde århundradet är målningen av semicatino av huvud APSE som presenterar den eviga bland keruberna. Interiören, även i små utrymmen, är slående för rytmens och proportionerna: kolonner och pelare, erhålls ofta med dekorativa element från klassiska byggnader och medeltiden, markera de tre navarna; galleriernas närvaro har satts i förhållande till traditionen av Sant ' Eufemia ockuperade området för det gamla kungliga residenset och ducale, där på typen av Palatinska kapellet i Aachen var gallerierna. Basilikan Sant ' Eufemia nås via Stiftsmuseet, som inrättades i den representativa vingen av Ärkebiskopens palats. Nyligen har det stigit till ny och inkongruös kändis även som kyrkan Don Matteo, i den välkända RAI 1 TV-serien.