Kanisa anasimama juu ya kilima katika nzuri mahali. Kwenye tovuti ya sasa ya kanisa kulikuwa na kanisa dogo kujengwa na Camaldolese watawa katika karne XI na wakfu kwa Saint Basil. Kanisa ilikuwa kuharibiwa wakati wa gunia la Cortona ya 1258 na upya katika 1288 na Santa Margherita ilikuwa wakfu kwa St Basil, Mtakatifu Egidio monaco na St Catherine ya Alexandria. Saint Margaret, katika chumba nyuma ya hii kanisa kidogo aliishi miaka ya mwisho ya maisha yake na akafa huko katika 1297. Yeye alikuwa na kuzikwa katika Kanisa la St Basil. Mara baada ya kifo cha Margherita ya cortonesi, karibu na kanisa, kujengwa kubwa ya kanisa kwa kubuni na Giovanni Pisano na katika 1330 wakiongozwa mwili wa Saint. Ya kumi na nne ya karne ya jengo kubaki tu Rose Dirisha katika facade, mnara wa kengele na kuta za nje ya kwaya. Katika karne ya kumi na nne ya kanisa kuendelea kuwa embellished na muhimu ya frescoes. Hii mural mzunguko na kuja kwetu tu vipande chache kuhifadhiwa katika Jimbo Makumbusho, lakini ushahidi wa hilo ni kuhifadhiwa katika kanuni ya karne ya kumi na saba kwamba nyaraka ishirini na moja watercolored pazia ukuta uchoraji waliopotea katika 1653 wakati, kutokana na hali mbaya ya Uhifadhi, wao walikuwa nikanawa mbali. Uchambuzi wa kuishi vipande inaongoza kwa tarehe yao ya kuzunguka 1335 na kwa sifa yao ya warsha ya mmoja au wawili wa Lorenzetti ndugu. Katika 1385 kanisa ilikuwa waliokabidhiwa Olivetan watawa, kubadilishwa katika 1389 na kuona watoto ambao bado kuchukua huduma hiyo na kuwakaribisha wageni. Kanisa alikuwa na mfululizo mabadiliko katika enzi ya kisasa, ambayo kumi na saba ya karne ya madhabahu kubaki, lakini muhimu zaidi, kwa mabadiliko, lakini kutoweka kabisa, alikuwa mmoja alitaka katika katikati ya '700 na John V, Mfalme wa Ureno, ambaye alikuwa na kupokea neema kutoka Saint. Sasa kanisa ni badala ya matokeo ya karne ya kumi na tisa-karne ya ujenzi, waliokabidhiwa kwanza kwa mbunifu Enrico Presenti, ambao kubadilishwa awali nave moja na basilika ya muundo, na kisha mbunifu Mariano Falcini, ambaye alimaliza takatifu jengo bila ya kumpendeza cortonese. Kwa hiyo, katika 1896 mbunifu Giuseppe Castellucci alikuwa utakamilika rudia facade, ambayo huzaa katika jicho kumi na nne ya karne ya rose dirisha ya zamani kubomolewa kanisa. Katika agosti 1927 ni muinuko na hadhi ya Minor basilica. Katika chapel ya kushoto transept ni kumi na nne ya karne ya jiwe sepulchral monument ya santa Margherita; kuheshimiwa bado wengine katika fedha urn (1646) katika Madhabahu ya Juu.
