Denna inte så turistiska basilika San Clemente al Laterano berättar Roms historia utifrån kyrkans olika lager. Den nuvarande kyrkan "San Clemente", tillägnad påven Clemens I, byggdes på toppen av en kyrka från 400-talet under 1100-talet. Under den har man hittat många fler romerska grundstenar. Den nuvarande basilikan är en av många i Rom och inte huvudanledningen till ditt besök, men rester av romerska hus (500-27 f.Kr.) har hittats 20 meter under denna kyrka. Man tror att husen förstördes av en stor brand under kejsar Neros regeringstid och senare användes som fundament.
Ovanpå dessa fundament hittades ytterligare ett stort hus som hade byggts på 1000-talet. Detta hus fungerade som en hemlig kyrka för påven Clemens vid den tiden, eftersom det ännu inte fanns någon religionsfrihet.
Under 400-talet, när religionsfrihet beviljades, byggdes en basilika ovanpå den hemliga kyrkan. Kyrkan tillägnades graven av den helige Klemens, den tredje efterträdaren till Petrus som påve. Det som gör denna basilika unik är hur rikt den dekorerades av målare och skulptörer.
År 1084 förstördes stora delar av kyrkan i vikingatåg, varefter påven Paschal lät bygga en ny kyrka ovanpå den gamla på 1100-talet. För att skapa ett starkt fundament murades delar av den gamla kyrkan igen och fylldes ut.
Sedan 1862 har många utgrävningar utförts för att frilägga antika strukturer, mosaiker och fresker från den nedre kyrkan. När du besöker kyrkan gör du en resa genom de olika lagren av dess historia.