V svetišče, posvečeno slika Santa Margherita, patroness od Cortona in Frančiškanski terciarno in kasnejši kulturne in duhovne aktivnosti opazovanja Frančiškani. Ob smrti Svetnika (februar 22, 1297) je bila sprejeta odločitev za gradnjo cerkve v njeno čast, ob stari Cerkvi San Basilio, da Margherita sama je obnovljena po izbiri je kot a mesto od pokore in molitve. Leta 1304 je bila sveta stavba že zgrajena, vendar je bila še naprej olepšana s pomembnimi freskami skozi štirinajsto stoletje. Le nekaj fragmentov ta zidana cikel, ki so prišli k nam v Diocesan Muzej, ampak dokaz, da je ohranjeno v kodo, ki je v sedemnajstem stoletju, da so dokumenti z enaindvajset watercolored prizorov stenskih poslikav izgubil v 1653, ko se zaradi svoje slabem stanju, Ohranjanje, so bili odplavilo. Analiza preživelih delcev jih pripelje do leta 1335 in jih pripiše delavnici enega ali obeh bratov Lorenzetti. Leta 1385 je bila cerkev zaupana menihom Olivetana, ki so jo leta 1389 zamenjali pomembni mladoletniki, ki še vedno skrbijo zanjo in sprejemajo obiskovalce. Avgusta 1927 je bila povzdignjena do dostojanstva Male bazilike.
