Ben Ezra ibodatxonasi dunyodagi eng qadimiy ibodatxona hamda eng uzoq xizmat qiluvchi hisoblanadi. A ibodatxona kamida 9-asrdan beri saytida turib, 1950 yilda Isroilga bir ommaviy chiqish qadar Misr yahudiy hamjamiyat uchun ibodat joyi bo'lib xizmat qildi.uning tarixi davomida, ibodatxona qayta qilindi.
Fotimiylar xalifasi Al-Hakim bi-Amr Alloh barcha yahudiy va nasroniy ibodat joylarini vayron qilishni buyurganidan keyin asl bino 1012 atrofida parchalanib ketgan. Sinagoga 1025 – 1040 o'rtasida qayta qurilgan va keyin butunlay 1890-yillarda yana bir marta qayta. Misr ibodatxonalari deyarli barcha kabi, Ben Ezra sayyohlik va muzey bugun.