A város nagy Tanácsa 1561-ben alapította meg a Régészeti Múzeumot. Az 1800-as években a Római sírkövek gyűjteményét P. Vimercati Sozzi és G. Mantovani, majd később Lombardia Régészeti Főfelügyelőségének megállapításaival gazdagították. Az őskori szakasz a neolitikumtól a Bergamo területének Vaskoráig terjedő darabokat tartalmaz. Különösen fontosak a Brembate Di Sotto golasecca temetőjéből származó cinerary urnák. A temetkezési helyek több darabja a római kultúra gallikus leletei és tárgyai. A lapidary szekció Római sírköveket mutat be, amelyek bizonyítják az őslakos kelta családok és az északra költözött Római állampolgárok jelenlétét. A városnak szentelt részben elmondjuk Bergamo történetét, Golasecca protohisztórikus településétől a Római Városházáig. A domus freskói az I. E. első és második század vége között keletkezhetnek. A szobrok vonzzák a figyelmet a magas színvonalú, valamint az ókorban (I. században). A felső-középkori rész Gótikus és Lombard darabokat mutat be, köztük egy figyelemre méltó harcos arzenált. Néhány arany levél kereszt kiváló műalkotás.