Chiesa di San Francesco a fost fondată la mijlocul anilor ' 200 de San Francesco, care în acei ani a rămas în Massa Marittima pentru a promova formarea unui prim nucleu de călugări ai Ordinului. Structura Bisericii, atașată unei mănăstiri, este extrem de simplă, în stil gotic, cu un singur naos și arcade de sprijin ogival și a fost inițial amplasată în interiorul zidurilor orașului. Exteriorul era caracterizat de ferestre mari ascuțite. Biserica a suferit numeroase renovări, în principal din cauza surpării din cauza cutremurelor, iar nava a fost redusă în 1529 și de mai multe ori în secolele XVIII și XIX. Astăzi, de structura originală, doar o parte din ABSIDĂ și o parte din naos rămâne, în timp ce în interior se află Mormântul Bindoccio, fiul lui Margherita Aldobrandeschi și Nello Pannocchieschi (căsătorit în prima căsătorie pe PIA Dei Tolomei). Unele picturi din secolul al XVII-lea de Raphael Vanni sunt situate în apropierea celor trei altare.