Od otvaranja 2001. godine kardinal Carlo Maria Martini, u kojem je tada bio nazvan 2017. godine, Muzej je točka dolaska važnog projekta koji je dao svoj ključni doprinos nekim od najvećih figurica nadbiskupa Milanskog dvadesetog stoljeća. Njegovo podrijetlo datira iz prvog razumijevanja Blaženog Ildefonso Schustera iz 1931. godine, a potom ga je obnovio kardinal Montini 1960. godine, koji označava kao mjesto novog muzeja samostana Sv. Konačno će kardinala martinija, osamdesetih godina, biti težak zadatak da započne rad na rekonstrukciji samostana koji je teško oštećen bombardiranjem Drugog svjetskog rata povjerenog proučavanju Belgiojosoa.Ovdje se nalazi, počevši od dvjesto, prvi Dominikanski milanski samostan i dva samostana, gdje se nalazi Muzej Bazilike sv.
Stalna zbirka biskupskog muzeja, koja zauzima drugo prebivalište, sastoji se od više od tisuću djela između II i XXI stoljeća. Iz nadbiskupskog trga došli su zbirke milanskih nadbiskupa (dio zbirke Monti, Visconti, Riccardi, Pozzobonelli i kompletna zbirka Erba Odescalci).
Osim slika iz crkava biskupije, muzej ima značajnu skupinu djela namještaja od bogoslužja. Zaokružuju zbirku sekcija posvećena zlatnim fondovima (uglavnom toskanski radovi XIV i XV stoljeća, okupili su profesor Alberto Crespi i darovali muzej), kao i skulpture i slike iz zbirke Catherine Marsenaro, crteži iz zbirke Sozzani i dragocjena baština Schuberta.
Konačno, brojne radove XX. i XXI. stoljeća dodane su prvoj jezgri skulpturalnih djela Lucije fontane, što ukazuje na sve veći interes muzeja za modernost.
