La Basílica de S. Cristina es una construcción románica del siglo XI con una fachada renacentista (1494) y un campanario ajimezado del siglo XIV. En el interior de las tres naves hay frescos de los siglos XIV-XVI y detrás del altar mayor hay un políptico bien restaurado de Sano di Pietro. La nave lateral izquierda conduce a la Capilla del Milagro (siglo XVII), cuyo altar contiene las piedras manchadas de sangre, reliquias del Milagro Eucarístico (1263), mientras que el Sacro Corporal, un mantel de altar manchado de sangre, se guarda en la Catedral de Orvieto. Adyacente a la Capilla del Milagro está la Gruta de Santa Cristina, parte de las catacumbas cristianas. En la cueva hay un gran icono de terracota y una estatua de Santa Cristina muerta, ambas obras de Benedetto Buglioni. Se dice que en el año 292 Cristina, la joven hija de un prefecto romano, feroz perseguidora de los cristianos, se convirtió a la nueva fe. El monstruoso padre, enfurecido y decidido a castigar a la joven, la sometió a horribles torturas. Entre ellas estaba el corte de su lengua. Luego ordenó que la arrojaran a las aguas del lago con una piedra atada al cuello. Sin embargo, ésta flotaba milagrosamente en lugar de ir al fondo, salvando así a la niña y mostrando a todos los escépticos espectadores su indiscutible santidad, pero la atrocidad de las torturas sufridas no permitió que Cristina sobreviviera, y unos días después terminó muriendo. La piedra milagrosa, sin embargo, se conservó y pronto se convirtió en el altar que sería el protagonista, diez siglos más tarde, de otro acontecimiento extraordinario. La Colegiata de Santa Cristina es de hecho conocida por el Milagro del Corpus Domini, que tuvo lugar, según la tradición, en 1263, cuando un tal Pietro da Praga, un sacerdote bohemio que se dirigía a Roma en peregrinación, decidió detenerse en Bolsena y celebrar la misa en el altar de Cristina. Como tenía dudas en su corazón sobre la transubstanciación, la mano divina (y tal vez el espíritu del santo) quiso rechazarlas, y durante la ceremonia la hostia consagrada saltó sobre el altar y rezumó sangre, para gran emoción de los fieles presentes. La piedra de Santa Cristina, manchada por la hostia sangrante, se conserva en la capilla barroca del Milagro (1693), donde también se puede admirar un cuadro de Francesco Trevisani, en memoria del sagrado acontecimiento. Desde la Capilla del Milagro se accede a la Gruta de Santa Cristina, que alberga (en un copón del siglo IX) una piedra de basalto con las huellas impresas de la Mártir (la habría pisado antes de ser empujada a las aguas del lago) y de la que parte un extenso y oscuro complejo de catacumbas, que datan de los siglos II a V d.C., donde se encuentra el sarcófago con los restos de la santa.