Byggnadens ursprung är officiellt daterat till den 29 januari 1240, då Fredrik II Hohenstaufen beordrade Riccardo da Montefuscolo, justitieminister i Capitanata, att förbereda material och allt som var nödvändigt för att bygga ett slott nära kyrkan Sancta Maria de Monte (som nu är försvunnen). Detta datum accepteras dock inte av alla forskare: enligt vissa hade byggandet av slottet vid detta datum redan nått upp till taken.Från och med 1600-talet följde en lång period av övergivenhet, under vilken slottet berövades sin inredning och sina väggdekorationer i marmor (vars spår endast syns bakom kapitälerna) och blev inte bara ett fängelse utan även ett skydd för herdar, rånare och politiska flyktingar. År 1876 köptes slottet, som befann sig i ett ytterst prekärt skick, slutligen (för 25 000 pund) av den italienska staten, som ordnade en restaurering som inleddes 1879. År 1928 tog restaureringen under ledning av arkitekten Quagliati bort murbruket utanför slottet och rev en del av de sönderfallande strukturerna för att senare återuppbygga dem och ge slottet ett "föryngrande" utseende. Detta stoppade inte dess försämring och ytterligare restaurering måste genomföras mellan 1975 och 1981. År 1936 förklarades Castel del Monte som ett nationellt monument.År 1996 uppfördes det på Unescos världsarvslista på grund av den matematiska och astronomiska stringensen i dess former och den harmoniska blandningen av kulturella element från norra Europa, den islamiska världen och den klassiska antiken, ett typiskt exempel på medeltida arkitektur.Trots att den ofta kallas för ett "slott" är den imponerande byggnadens exakta funktion fortfarande okänd. Arkitektoniskt sett saknar den typiska militära element och vallgravar, och den ligger i ett icke-strategiskt läge, och byggnaden var troligen egentligen inte en fästning. Vissa delar av konstruktionen utesluter dessutom definitivt denna hypotes: till exempel är spiraltrapporna i tornen placerade moturs (till skillnad från alla andra försvarskonstruktioner vid den tiden), vilket gjorde att slottets invånare hade en nackdel mot eventuella angripare eftersom de skulle ha tvingats hålla sitt vapen med vänster hand. Luckorna är också för smala för att man ska kunna anta att pilar kunde skjutas.Även hypotesen att det var ett jaktslott, en verksamhet som var mycket omtyckt av suveränen, ifrågasätts av förekomsten av fina ornament och avsaknaden av stall och andra rum som är typiska för jaktresidens.På grund av den starka symbolik som byggnaden är genomsyrad av har man antagit att byggnaden kan ha varit ett slags tempel, eller kanske ett kunskapstempel, där man ostört kunde ägna sig åt studier av vetenskaperna.I vilket fall som helst visar den sig vara ett storslaget arkitektoniskt verk, en syntes av förfinade matematiska, geometriska och astronomiska kunskaper.Vissa små asymmetrier i arrangemanget av de återstående dekorationerna och de inre dörrarna, när de inte beror på spoliering eller ändringar, har för vissa forskare gett upphov till tanken att slottet och dess rum, även om de är geometriskt perfekta, var utformade för att användas genom ett slags obligatorisk "väg", förmodligen kopplad till astronomiska kriterier.För att förklara den totala avsaknaden av korridorer har man också antagit att det på första våningen en gång i tiden fanns en balkong av trä, som nu är försvunnen, på den sida som vetter mot innergården, och som skulle ha möjliggjort oberoende tillträde till de enskilda rummen.En nyare hypotes skulle ge byggnaden funktionen av ett wellnesscenter, lämpligt för regeneration och kroppsvård, med det arabiska hamam som förebild. Flera element i byggnaden skulle leda i denna riktning: de många och geniala systemen för att leda och samla upp vatten, de många cisternerna för lagring, förekomsten av de äldsta badrummen i historien, hela komplexets särskilda utformning, den obligatoriska interna vägen och den åttkantiga formen.På grund av den åttkantiga formen, med lika många oktagoner placerade i den centrala planens hörn, kan man anta att byggnaden byggdes för att likna formen av en krona, vilket skulle förklara Castel del Montes funktion, dvs. en ytterligare bekräftelse på den kejserliga makten, ett monument.Den åttkantiga formen, som ligger till grund för planen för komplexet och dess delar, är en mycket symbolisk geometrisk form: den är en mellanfigur mellan kvadraten, som symboliserar jorden, och cirkeln, som representerar himlens oändlighet, och skulle således markera övergången från den ena till den andra.Valet av oktagonet kan härröra från Klippdomen i Jerusalem, som Fredrik II hade sett under det sjätte korståget, eller från Palatinska kapellet i Aachen.Hela konstruktionen är genomsyrad av starka astrologiska symboler och dess placering är utformad så att de skuggor som kastas av väggarna har en viss riktning under sol- och dagjämningen. Vid middagstid på höstdagjämningen, till exempel, når väggarnas skuggor perfekt hela innergården, och exakt en månad senare täcker de också hela rummens längd. Två gånger om året (den 8 april och den 8 oktober, och oktober ansågs på den tiden vara årets åttonde månad) kommer dessutom en solstråle in genom fönstret i den sydöstra väggen och passerar genom fönstret som vetter mot innergården och lyser upp en del av väggen där ett basrelief tidigare var inristat.På de två kolonnerna som flankerar ingångsportalen sitter två lejon på huk, den högra tittar åt vänster och vice versa, och vänder sig mot de punkter på horisonten där solen går upp vid de två sommar- och vintersolståndet.En annan egenhet i byggnaden kan noteras: till de fem vattencisternerna under tornen är fem skorstenar inuti idealiskt anslutna. Vissa har relaterat detta till orden i Lukasevangeliet: "I dag döper jag er med vatten, men han ska komma och döpa er med eld", vilket ger stöd åt hypotesen att byggnaden användes som ett slags tempel.Det har noterats att byggnaden på långt håll ser ut att likna en krona, särskilt den som Fredrik II själv kröntes med (också den är åttakantig).Om man på ett idealiskt sätt skulle klippa byggnadens ingångsportal med en vertikal linje som går genom dess axel, skulle man kunna se ett stort F, initialerna för den suverän som ville ha den och som kanske på så sätt lämnade sitt märke och sin signatur. Trapporna skulle också ha utformats så att den som gick ut aldrig kunde vända ryggen åt byggnaden eller initialen för den man som lät bygga den.Siffran åtta återkommer i olika delar av denna konstruktion: Byggnadens åttkantiga form, den inre gården och de åtta tornen i topparna, de åtta inre rummen, den inre bassängen som skulle vara åttkantig, åtta fyrbladiga blommor på den vänstra ramen på ingångsportalen, ytterligare åtta på den nedre ramen, åtta blad på pelarnas kapitäl i rummen, åtta blad på nyckelstenen, åtta vinblad på grundstenen i det första rummet på bottenvåningen, åtta solrosblad på grundstenen i ett annat rum, åtta blad och åtta kronblad på grundstenen i det femte rummet, åtta akantusblad på grundstenen i det åttonde rummet, åtta fikonblad på grundstenen i det åttonde rummet på övervåningen.