I documenti storici più antichi del castello di Wasserburg risalgono al 1185. L'aristocratico Dietmar von Wasserburg fu il primo proprietario noto della tenuta. Fino al 13° secolo Wasserburg rimase in possesso della linea dei von Wasserburg, il cui membro più notevole era Heinrich von Wasserburg, che era il cognato del famoso menestrello Ulirch von Lichtenstein. La leggenda dice che von Lichtenstein ebbe un ruolo di primo piano nella liberazione di Re Cuor di Leone durante la sua prigionia austriaca. Nel 1238 il nobile Otto von Haslau prese possesso di Wasserburg. Un paio d'anni più tardi la tenuta passò attraverso il matrimonio in possesso della linea aristocratica Puchberger.
Nel XIV secolo la famiglia von Toppel abitò Wasserburg, ma già nel 1515 Christoph von Zinzendorf comprò Wasserburg e lo incorporò al possesso della famiglia di vasti possedimenti in tutte le terre imperiali austriache. Gli Zinzendorf usarono Wasserburg come loro casa ancestrale e principale proprietà di famiglia per più di 400 anni. Nel 1813 il conte Heinrich von Baudissin adottò lo stemma e il nome del defunto Heinrich von Zinzendorf. Il conte Baudissin-Zinzendorf, originario di Holstein in Germania, introdusse la tradizione protestante dell'albero di Natale in Austria, si dice che l'albero di Natale del 1827 a Wasserburg fu il primo del suo genere nell'impero austriaco.
1912 il conte Baudissin-Zinzendorf vendette Wasserburg al conte Heinrich Fuenfkirchen. Durante la Grande Guerra il castello funzionò come casa di ricreazione per i soldati del fronte. Nel 1923 il conte Carl Hugo Seilern e Aspang acquistarono la proprietà e rimane fino ad oggi in possesso della famiglia Seilern-Aspang.
Oggi Wasserburg può essere affittato. C'è anche un centro di yoga.
Riferimenti: Schloss Wasserburg
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