Una estada a la capital de Malta no està completa sense visitar la concatedral de Sant Joan de Malta. El projecte va ser encarregat l'any 1572 pel Gran Mestre Jean de la Cassiere per servir com a església de l'Orde dels Cavallers de Sant Joan, i va ser dissenyat per l'arquitecte maltès Gerolamo Cassar. L'obra es va acabar el 1577 i va ser dedicada a Sant Joan Baptista, un dels dos sants patrons de l'Orde. La cocatedral de Sant Joan a La Valletta mostra la importància del cristianisme per al país de Malta. Des de l'exterior, aquesta catedral del segle XVI potser no sembla gaire, però fes un cop d'ull a l'interior i t'espera una autèntica sorpresa. La catedral va ser reformada al segle XVII i té una opulenta decoració barroca. A més del seu ric art i relíquies barrocs, la Catedral de la Co també conserva impressionants frescos barrocs, terres de marbre ornamentats, estàtues tridimensionals, parets de pedra tallada i impressionants sostres de volta decorats pel conegut artista barroc italià, Mattia Preti. La Concatedral també acull una de les obres més reconegudes internacionalment de Miquel Àngel Merisi da Caravaggio, coneguda com ‘La decapitació de sant Joan Baptista’ (1608). El quadre, situat dins de l'Oratori, és l'obra d'art més gran de Caravaggio i l'única que porta la seva signatura. Cada dia de l'any, els visitants es dirigeixen a la catedral per veure la famosa obra d'art, i molts tornaran a la catedral cada vegada que estiguin a l'illa. La mateixa Catedral consta de nou capelles eloqüentment decorades a banda i banda; es van construir vuit per a cadascuna de les llengües dels cavallers de Sant Joan, i la novena està dedicada a la seva patrona, la Mare de Déu de Filerm, l'altra patrona de l'Orde. La darrera capella també alberga una antiga icona de la dama de Filerm, que els cavallers consideraven un objecte sagrat. La concatedral de Sant Joan de Malta també conté una misteriosa cripta que conté les tombes dels antics Grans Mestres dels Cavallers de Sant Joan.