A Civita di Bagnoregio valójában nagyon bizonytalan talajon áll, egy tufafennsíkon helyezkedik el, és az összeomlás veszélye fenyegeti, mivel a hatalmas agyagpadok, amelyek alátámasztják, folyamatos eróziónak vannak kitéve.BALNEUM REGIS először 599/600-ban jelenik meg Nagy Gergely pápa Chiusi Ecclesio püspökének címzett levelében. Korábbi dokumentumok nem tanúsítják a toponimust vagy más nevet. A Balneum regis gót-lomgobárd eredetű toponím, amely királyi birtokot jelöl. Nem valószínűtlen, hogy egy fürdőkomplexummal állt kapcsolatban, amire kevés bizonyíték áll rendelkezésre.Az első biztos történelmi információ Bagnoregióról, vagy inkább Bagnorea, ez a legrégebbi neve, a Kr. u. 6. századból származik, amikor az itáliai püspöki székhelyek között említik. Az azonban bizonyos, hogy a Római Birodalom bukása után Bagnoregio előbb a gótok, majd a longobárdok uralma alá került, végül Nagy Károly a toszkániai Szent Péter patrimóniájának fennmaradó részével együtt a pápaságnak adta. A frank hódítás után hűbérurak sora váltotta egymást a hatalom gyakorlásában, köztük a Monaldeschik, akik később Orvieto urai lettek.A 12. században szabad településsé vált, amely a virágzás, valamint a kulturális és művészeti életerő időszakát élte át. A közeli, nagyhatalmú Orvieto fenyegetése azonban továbbra is fennállt, amelynek politikai pályáján Bagnoregio mindenképpen ebben az időszakban helyezkedik el. A két város közötti viszony időnként elkeseredetté és konfliktussá vált, és még a szomszédos központokat is belekeverték a harcokba. Bagnoregio azonban, bár háborúkba és megszállási kísérletekbe keveredett, meg tudta őrizni viszonylagos autonómiáját.Az 1348-as szörnyű pestisjárvány (amelyről Boccaccio Dekameronjában olvashatunk) a várost egykori önmagának árnyékává tette; állítólag egyetlen nap alatt több mint 500 ember halt meg. 1494-ben a bagnoresieknek sikerült lerombolniuk a Monaldeschi della Cervara erődítményét, hogy végleg megszabaduljanak a gyűlölt zsarnokok visszatérésének veszélyétől.1494-ben a Bagnoresi bátran ellenállt VIII. Károly francia király bevonulásának a városba, aki seregével Nápoly felé tartott, hogy elfoglalja azt. Ez a hősies tett azonban nem járt elismeréssel VI. Sándor Borgia pápa részéről, aki két évvel később csapást mért a közösségi szabadság büszke érzésére, amikor bevezette a bíboros-kormányzók rendszerét, amely 1612-ig tartott, amikor Bagnoregio a viterbói apostoli küldöttség ellenőrzése alá került, amely vállalta, hogy tiszteletben tartja az 1367-es ősi közösségi statútumokat. A bagnoregioi közösség élete nyugodtan folyt, inkább a városuk természeti és geológiai viszontagságai, mint politikai események vagy háborús cselekmények zavarták meg. Csak 1867-ben történt katonai felfordulás, amikor a pápai milícia és Garibaldi önkéntesei között lezajlott az első heves összecsapás, amelyet a történelem "Bagnoreai csata" néven jegyez. 1870-ben Bagnoregio végül az Olasz Királyság része lett.Civita di bagnoregio egy titokzatos varázzsal bíró hely. A még nem értelmezett maradványok, a földalatti alagutak hatalmas hálózata és a földrajzi elhelyezkedése még a közelmúltban is elemzésekre és hipotézisekre adtak okot az eredetével és a rituálékkal kapcsolatban, egészen odáig, hogy a Fanum Voltumne, az etruszk nép szentélyének egyik lehetséges helyszíneként azonosították.
