Zapravo, Civita di Bagnoregio stoji na vrlo nesigurnom tlu, smještenom na ploči od sedre, i rizikuje da se uruši jer su ogromne glinene obale koje ga podupiru podložne kontinuiranoj eroziji.BALNEUM REGIS se prvi put pojavljuje 599/600. godine u pismu pape Grgura Velikog upućenom biskupu Chiusi Ecclesio. Ne postoje prethodni dokumenti koji potvrđuju toponim ili drugu denominaciju. Balneum regis je toponim gotsko-lombardskog porijekla, koji definira kraljevsko vlasništvo. Veza sa termalnim kompleksom za koji postoje ograničeni dokazi nije nevjerovatna.Prvi određeni istorijski podaci o Bagnoregio, odnosno Bagnorea, ovo je njegov najstariji naziv, datira iz 6. veka nove ere. kada se spominje među italijanskim biskupskim sjedištima. Međutim, izvjesno je da je nakon pada Rimskog Carstva Bagnoregio potpao prvo pod vlast Gota, a potom Langobarda, a na kraju ga je Karlo Veliki predao papinstvu zajedno s preostalim dijelom baštine S. Pietra u Tuscia. Nakon franačkog osvajanja, niz feudalaca izmjenjivao se u vršenju vlasti, treba spomenuti Monaldeschis, koji su kasnije postali gospodari Orvieta.U 12. vijeku postaje slobodna opština, doživljava period procvata i kulturno-umjetničke živahnosti. Međutim, prijetnja obližnjeg i moćnog Orvieta i dalje se nazirala u političkoj orbiti u koju se Bagnoregio svakako mora postaviti u ovom periodu. Ponekad su odnosi između dva grada postajali gorki i sukobljeni, a čak su i granični centri bili uvučeni u borbe. Međutim, čak i ako je bio uključen u ratove i pokušaje da zauzme Bagnoregio, uspio je održati relativnu autonomiju.Užasna epidemija kuge iz 1348. (ona koju Bokačio pripovijeda u Dekameronu) svela je grad u sjenu samog sebe, kaže se da je u jednom danu bilo više od 500 mrtvih. Godine 1494. Bagnoresi su uspjeli uništiti dobro opremljenu tvrđavu Monaldeschi della Cervara kako bi se definitivno oslobodili opasnosti od povratka omraženih tiranina.Godine 1494. Bagnoresci su se hrabro usprotivili ulasku u grad francuskog kralja Karla VIII, koji je sa svojom vojskom upućen u Napulj da ga zauzme. Ipak, papa Aleksandar VI Bordžija nije zahvalio na herojskom djelu, koji je dvije godine kasnije zadao težak udarac ponosnom osjećaju slobode zajednice uvođenjem režima kardinala-guvernera koji je trajao do 1612. godine, godine u kojoj je Bagnoregio prešao pod vlast. kontrolu apostolske delegacije iz Viterba koja se obavezala da će poštovati drevne opštinske statute iz 1367. Život zajednice Bagnorese tekao je mirno, više uznemiren prirodnim i geološkim peripetijama njihovog grada nego političkim ili vojnim događajima. Tek 1867. godine došlo je do vojnog potresa kada je došlo do prvog nasilnog sukoba između papinih milicija i Garibaldijevih dobrovoljaca koji historija pamti kao "bitku kod Bagnoree". 1870. Bagnoregio je konačno postao dio Kraljevine Italije.Civita di Bagnoregio je mjesto gdje je uhvaćen misteriozni i misteriozni šarm. Ostaci koji još nisu protumačeni, ogromna mreža podzemnih tunela, sam njegov geografski položaj dali su povoda, čak iu novije vrijeme, za analize i hipoteze o njegovom porijeklu i obredima, sve do identifikacije jedne od mogućih lokacija Fanum Voltumne, svetilišta etrurska nacija.
