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Desde 2011, todo el complejo forma parte del sitio "Lombardos en Italia: lugares de poder", inscrito en la Lista del Patrimonio Mundial de la UNESCO. Alrededor de la iglesia, que data del año 760, comenzaron a desarrollarse monumentos que son un magnífico testimonio del arte arquitectónico y escultórico de los lombardos. Poco después se construyó el monasterio benedictino, mientras que después de 1119 se proyectaron otros cambios: se añadió el campanario románico y otros elementos del mismo estilo, como columnas y bajorrelieves. Los añadidos medievales se derrumbaron hacia 1700 debido a los terremotos y la iglesia se reconstruyó en estilo barroco y se amplió considerablemente.
La fuente, creada en 1806, fue diseñada por el arquitecto Nicola Colle De Vita. Consiste en una pila circular en cuyo centro se encuentra un obelisco, a lomos de cuatro leones de cuyas bocas brota el agua. El obelisco estaba coronado por un globo terráqueo con el águila imperial, emblema de la Francia napoleónica, en bronce.
El primer campanario fue construido por Gregorio II, abad de Santa Sofía entre 1038 y 1056, bajo el principado de Pandulf III, como reza un epígrafe en una placa incrustada en el muro sur del actual, y protegía la tumba de Arechi II. Se derrumbó en el terremoto del 5 de junio de 1688, cayendo sobre el atrio monumental construido en el milenio. El nuevo campanario fue reconstruido en 1703, en una posición diferente a la original, dentro de los muros que entonces encerraban el convento y el jardín. En 1915, corría el riesgo de ser derribado por la administración municipal, que lo consideraba un estorbo innecesario, y en absoluto una obra de arte a conservar; pero Corrado Ricci intervino ante el ministerio competente para que esta obra de destrucción no se llevara a cabo. El claustro de Santa Sofía, mandado construir por el abad Juan IV, data de mediados del siglo XII y tiene una planta cuadrangular, a excepción de una esquina replegada en el ángulo noroeste. Consta de amplias arcadas sostenidas por un total de 47 columnas de granito, piedra caliza y alabastro, entre las que hay ventanas de cuatro luces con arcos de herradura. En los capiteles y pulvinos se representan escenas de gran variedad, y los ejecutores materiales son variados. Sólo un capitel representa escenas de la infancia de Cristo. Cinco están dedicados al ciclo de los meses, con inscripciones explicativas. Otra categoría contiene escenas de caza y peleas entre hombres y animales. También hay escenas de combate entre jinetes, talladas en estilos muy diferentes. También hay centauros y otros animales fantásticos. Otros temas hacen hincapié en los vicios de la naturaleza humana, en particular la ira y la lujuria. Los temas bíblicos son poco frecuentes, como el símbolo del Tetramorfo o San Miguel atravesando al Dragón. Los arcos de las aberturas son segmentarios, de estilo morisco. Sostienen la gran terraza de arriba, a la que se abren las habitaciones del antiguo monasterio, ahora salas del Museo del Sannio.
El monasterio fue un centro cultural de primer orden, hasta el punto de que hacia el año 1000 llegó a contar con nada menos que 32 doctores en artes liberales.
