Os frescos que decoran a Cripta de Epifanio atópanse entre os exemplos máis importantes da pintura europea altomedieval, pola calidade técnica e formal, a complexidade dos temas representados e o excelente estado de conservación.As representacións comezan coa imaxe dunha man tendida, sobre a fiestra do brazo norte, símbolo da man do Pai Eterno que alude á orixe sobrenatural da luz, vehículo de revelación da Verdade. O muro leste narra a Encarnación do Verbo en Cristo, a renovación da alianza co home que permite a súa salvación (a Anunciación; o embarazo de María; o nacemento; o lavado de Cristo; a Crucifixión, baixo a que se representa o abade Epifanio). ; a visita das Pie Donne ao Santo Sepulcro e Cristo, San Lorenzo e Santo Stefano dentro dun nicho). Á dereita do brazo oriental está a representación de María Regina sentada no trono, vestida de emperatriz bizantina. Sostén o neno Xesús nos seus brazos sostendo o pergamiño da lei que renova o pacto de alianza entre Deus e o home. Aos pés das figuras hai retratos de personaxes non identificadosNo muro oeste, porén, nárrase o testemuño dos que optaron por crer en Xesús aceptando o martirio. O grupo de representacións comeza co descenso de Cristo ao Limbo, pintado na bóveda sobre a entrada, seguido, na parede, dunha teoría de santas no acto de ofrecer a Cristo a coroa de xoias, símbolo do seu martirio e, por riba máis aló da ábsida central, as torturas de San Lorenzo e Santo Stefano, separadas por un nicho coa representación dun diácono en oración.A narración alcanza o seu punto culminante na ábsida onde se representan algúns elementos das visións de Xoán Evanxelista e relatados no Libro de Apocalipse (os catro anxos nos catro cantos da terra para conter os ventos e o quinto anxo, quizais Cristo). el mesmo, que ascende de Oriente co selo do Deus vivo). Sobre a figura do quinto anxo volve estar María Regina, sentada nun trono, leva nas súas mans un libro aberto cos primeiros versos do "Magnificat" cos que agradece a Deus a súa maternidade milagrosa. A súa posición podería aludir ao papel de mediador entre Deus xuíz e a humanidade. Baixo os pés do quinto anxo tamén hai vestixios dunha pequena figura axeonllada, que as letras que se conservan da inscrición permiten identificar cun bispo "episc[opus]", probable comisario das obras. Finalmente, a imaxe de Cristo Pantocrátor é central no punto no que se cruzan os brazos.A banda decorativa que percorre a parte baixa dos muros reproduce os motivos dos tecidos que se empregaban para colgar nos muros das igrexas; en particular, diante da entrada represéntase un nó apotropaico que se utilizaba para afastar as forzas do mal. Finalmente, na ábsida reprodúcense pelícanos que, na simboloxía cristiá, son unha metáfora de Cristo que se sacrifica na Última Cea, porque para alimentar aos seus cativos róganlles a pel ofrecendo o seu propio sangue.