Universitetet, der blev grundlagt i 1290, er den mest berømte attraktion i Coimbra. Det historiske sted ligger i øvre Coimbra, den gamle kerne af byen, og inkluderer elegante og stramme Middelalderlige og Renæssancepaladser samlet omkring Pateo das Escolas og domineret af et imponerende tårn, hvis klokke markerer rytmerne i det akademiske liv. Den mest besøgte bygning er det storslåede bibliotek Joanina, hvilket bevarer mere end 300 tusind bind fra det sekstende til det attende århundrede, arrangeret på elegant indrettet med hylder talha dourada (udskåret træ belagt med en guld-folie). Sådan besøger du University of Coimbra med undtagelse af biblioteket er adgang til universitetscampus gratis, og du kan selv besøge det; hvis du foretrækker en guidet tur, er der tre om dagen. Universitetet er en scene inkluderet i næsten alle de guidede ture i byen Coimbra. Det er ikke strengt nødvendigt at besøge universitetets historiske sæde for at indse den betydning, det har og stadig gør i byens historie. Du kan møde universitetsstuderende overalt: de fleste traditionalister bærer det traditionelle akademiske kostume, der består af en kappe og en sort kjole, en hvid skjorte og i nogle tilfælde en hovedbeklædning eller et våbenskjold. Hvis du besøger Coimbra i Maj, kan du se afbrænding af bånd, den livlige Rite, som kandidater fejrer afslutningen på deres studier med. En af de kulminerende begivenheder i festlighederne er Fado de Coimbra, en serenade, som studerende synger på trappen til s vel Velha, Byens katedral.