L'extérieur non fini présente un beau portail en marbre. A l'intérieur se trouvent les restes de Jacopone da Todi. Le plan de l'église comporte trois nefs gothiques, chacune avec une entrée depuis la façade et des portes ornées de bas-reliefs historiés représentant des saints, des prophètes bibliques et des ornements floraux. Le long des nefs se trouvent 13 chapelles avec des fresques et des statues, dont la magnifique fresque de la Vierge à l'Enfant avec deux anges de Masolino da Panicale. En descendant dans la crypte, on trouve la tombe en marbre de San Fortunato et la pierre tombale de Jacopone. Depuis la sacristie, en montant le haut clocher, on peut admirer un merveilleux panorama de collines typiques de l'Ombrie.
