Bu eşsiz müze, insan kültürü ve medeniyetinin vazgeçilmez bir temeli olan ekmeğin 6.000 yıllık tarihine adanmıştır. Müze, kuruluşunu ve büyümesini Willy Eiselen (1896-1981) ve oğlu Hermann Eiselen'in (1926 doğumlu) onlarca yıl süren kişisel çabalarına borçludur. Her ikisi de fırıncılık malzemeleri üretimi ve satışı ile uğraşmış ve fırıncılık ticaretinin önde gelen tedarikçileri arasında yer almıştır.
İki girişimci müzeyi 1955 yılında Alman Ekmek Müzesi adıyla bir dernek olarak kurdu. İlk kalıcı sergi 1960 yılına dayanıyor. Dünyada türünün ilk ve uzun yıllar boyunca tek müzesiydi. Kurucuları tarafından finanse edilen tamamen özel bir kurumdu. 1991 yılında müzenin finansmanı bağımsız bir hayır kurumu olan Eiselen Vakfı tarafından devralındı; aynı zamanda müze Ulm'ün merkezindeki tarihi bir depo olan Salzstadel'e taşındı.
Müze burada gelişti ve 2004 yılında bir milyonuncu ziyaretçisini ağırladı.
