Freskerna i Epiphaniuskryptan är bland de viktigaste vittnesmålen från den tidiga medeltidens europeiska måleri på grund av deras tekniska och formella kvalitet, komplexiteten i de avbildade ämnena och deras utmärkta bevaringstillstånd.Skildringarna börjar med bilden av en utsträckt hand, ovanför fönstret i den norra armen, som symboliserar den evige faderns hand och som anspelar på ljusets övernaturliga ursprung, som är ett medel för att avslöja sanningen. På den östra väggen berättas ordets inkarnation i Kristus, förnyelsen av förbundet med människan som gör det möjligt för henne att bli frälst (tillkännagivandet, Marias graviditet, födelsen, tvättningen av Kristus, korsfästelsen, under vilken abbot Epiphanius är avbildad, de fromma kvinnornas besök vid den heliga graven och i en nisch Kristus, den heliga Laurentius och den heliga Stefan). Till höger om den östra armen finns en avbildning av Maria drottning som sitter på en tron och är klädd som en bysantinsk kejsarinna. Hon håller Jesusbarnet i sina armar och håller lagens bokrulle som förnyar förbundet mellan Gud och människa. Vid figurernas fötter finns oidentifierade figurer.På den västra väggen skildras vittnesmålen från dem som valde att tro på Jesus genom att acceptera martyrskapet. Gruppen av avbildningar börjar med Kristi nedstigning till Limbo, målad i valvet ovanför ingången, följt av, på väggen: en teori om helgon som håller på att erbjuda Kristus den ädelstenarförsedda kronan, symbol för deras martyrskap, och, bortom den centrala absiden, tortyrerna av den helige Laurentius och den helige Stefanus, åtskilda av en nisch med avbildningen av en bedjande diakon.Berättelsen når sin höjdpunkt i absiden där vissa delar av de visioner som evangelisten Johannes hade och som finns nedtecknade i Uppenbarelseboken avbildas (de fyra änglarna vid jordens fyra hörn för att hålla tillbaka vindarna och den femte ängeln, kanske Kristus själv, som stiger upp från öster med den levande Gudens sigill). Ovanför den femte ängelns figur finns återigen drottning Maria, sittande på en tron, med en öppen bok i händerna med de första verserna av "Magnificat", med vilka hon tackar Gud för sitt mirakulösa moderskap. Hennes ställning kan anspela på hennes roll som medlare mellan Gud som domare och mänskligheten. Under den femte ängelns fötter finns det också spår av en liten, knäböjd figur, som med hjälp av de kvarvarande bokstäverna i inskriften kan identifieras med en biskop "episc[opus]", den troliga beställaren av verket. Centralt är bilden av Kristus Pantokrator i den punkt där armarna korsar varandra.Det dekorativa band som löper längs den nedre delen av väggarna återger motiven i de tyger som brukade hänga på kyrkornas väggar. Särskilt mittemot ingången avbildas en apotropa knut som skulle avvärja de onda krafterna. Slutligen finns det i absiden reproduktioner av pelikaner som i den kristna symboliken är en metafor för Kristus som offrade sig själv vid den sista måltiden, eftersom de för att föda sina ungar sliter sönder sin hud och erbjuder sitt eget blod.