Graven til St. Clare blev designet og ønsket uden for porta urbica, i kirken San Giorgio, hvor Francis allerede midlertidigt blev begravet, og hvor helgen blev begravet den 12.August 1253. Kirken San Giorgio var lige uden for den enslydende indgangen til byen, en smule lavere end den vej, der forlader byen, med overskriften "versus Ispellum"; en anden vej gik op til san Rufino, og en tredje, langs den Romerske mur, ned mod porta Moiano. Derfor blev stedet kaldt"Tribium S. Georgii". Mellem vejen og kirken stod for ikke længe siden et hospital knyttet til kirken; alt afhang af katedralens kapitel.
Mens det for kirken-mausoleet, for at være rejst til ære for Frans af assisi, det sted var fast besluttet på kun to år efter hans død, for at være dedikeret til St. Clare vi straks orienteret mod den modsatte del af byen, lige ved siden af Kirken church of St. George (Marino Bigaroni, Basilica of St. Clare i Assisi, s.13). Tre år efter dødsfaldet, og et år efter canonization af St. Clare begyndte i 1257 opbygningen af Basilikaen St. Clare rundt i den gamle Kirke St. George, som indtil 1230 havde holdt de jordiske rester af St. Francis. Resterne af Saint var flyttede allerede i 1260, mens den højtidelige indvielse fandt sted i 1265, i overværelse af Clement IV. Byggeriet blev udført af arkitekten Filippo Da Campello. Krypten, der nu huser helligens grav, blev først bygget i 1850.