Hong Kong Museum of History blev etableret i juli 1975, da City Museum and Art Gallery var opdelt i Hong Kong Museum of History og Hong Kong Museum of Art. Men nogle af museets samlinger går tilbage til Bymuseet og kunstgalleriet, der blev grundlagt i 1962 på rådhuset. I 1983 blev museet flyttet til den midlertidige indkvartering i Ko .loon Park. Det blev flyttet til sine nuværende lokaler på Chatham Road South, Tsim Sha Tsui i 1998. Det permanente hjem for Hong Kong Museum of History, med et brutto gulvareal på 17.500 m2, har til huse i en ny bygning baseret på det arkitektoniske koncept af E. Verner Johnson. Det nye Museum og det nærliggende Videnskabsmuseum udgør tilsammen et museumskompleks med et harmonisk udseende og farveskema.