Hrob Svaté Kláry byl navržen a chtěl mimo porta urbica, v Kostele San Giorgio, kde František už byl dočasně pohřben a kde Světec byl pohřben dne 12. srpna 1253. Kostel San Giorgio byl jen kousek od stejnojmenné brány města, o něco nižší než na silnici, opuštění města, v čele "versus Ispellum"; další cesta šla nahoru do san Rufino, a třetí, podél Římské zdi, pocházející směrem k porta Moiano. Proto bylo místo nazýváno "Tribium s. Georgii". Mezi silnicí a kostelem stála nedávno nemocnice připojená k církvi; vše záviselo na kapitole katedrály.
Zatímco pro kostel-mauzoleum, které má být postaveno na počest svatého Františka, bylo místo určeno pouze dva roky po jeho smrti, pro ten, který má být zasvěcen sv. Clare, jsme se okamžitě orientovali na opačnou část města, hned vedle kostela sv. Tři roky po smrti a rok po kanonizaci sv. Kláry začala v roce 1257 stavba baziliky sv. Kláry kolem starobylého kostela sv. Jiří, který až do roku 1230 uchovával smrtelné pozůstatky sv. Františka. Ostatky Světce byly přesunuty již v roce 1260, zatímco slavnostní vysvěcení proběhlo v roce 1265, v přítomnosti Klement IV. Stavební práce provedl architekt Filippo Da Campello. Krypta, ve které se nyní nachází hrobka svatého, byla postavena až v roce 1850.