Considerată a fi cea mai reprezentativă a unui grup de biserici coloniale din orașul Vechi, Biserica Santa Clara a fost construită între 1629 și 1674 ca parte a mănăstirii sărace Clares. Fiind una dintre cele mai vechi biserici ale orașului, este bogat decorată cu 112 picturi și 24 de sculpturi care datează din secolele 17 și 18. Este o biserică muzeu condusă de municipalitate, deci nu este liberă să intre, dar merită cu siguranță fiecare peso.