Basilica inasimama kwenye barabara ya jina moja na ilijengwa mahali ambapo, kulingana na hadithi, muundo wa asili uliojengwa na Saint Helena, mama wa mfalme Constantine, tayari ulikuwapo. Kwa kweli, magofu ya hekalu la kipagani lililowekwa wakfu kwa Ceres yalipatikana katika eneo hilo. Hapa, watawa wa Basilian, ambao walikimbia kutoka Constantinople katika karne ya nane na masalio ya San Gregorio, ilianzishwa, kwa amri ya askofu wa Naples Stefano II, Fondaco di San Gregorio ambayo, baadaye, katika 1225, iliunganishwa na monasteri za San Sebastiano na San Pantaleone. Baada ya Mtaguso wa Trento, sheria kali zaidi za marekebisho ya kupinga urekebishaji zilifanya iwe muhimu kujenga muundo mpya wa makao ya watawa. Kama ushahidi wa "uhamiaji" huu, daraja, ambalo baadaye likawa mnara wa kengele, ambao unaunganisha miundo miwili bado. Kati ya 1574 na 1580, kutokana na shauku ya Fulvia Caracciolo na Shangazi Lucrezia, Vincenzo della Monica na Giovan Battista Cavagni walikabidhiwa ujenzi wa kanisa jipya na monasteri mpya, ambayo baadaye ilipanuliwa mnamo 1694 na Francesco Antonio Picchetti. Mwisho wa kazi, Idria Chapel pekee ndiyo iliyobaki ya muundo wa zamani, ambayo inaweza kufikiwa kutoka kwa chumba cha kulala. Katika karne ya kumi na nane kanisa lilitajirishwa na mambo ya kawaida ya Baroque ya Neapolitan, kama vile mpako, marumaru na shaba. Pia ilikuwa na chombo na vibanda viwili vya kwaya katika mbao zilizochongwa na mbunifu Niccolò Tagliacozzi Canale ambaye alifanya kazi kwenye muundo huo kati ya 1730 na 1750.Kitambaa hicho kina nguzo nne za Tuscan, na madirisha matatu makubwa ya arched ambayo hapo awali yalipitiwa na tympanum, baadaye ilibadilishwa na agizo la tatu la usanifu. Lango kuu lilianzia mwisho wa karne ya 16 na, katika kila sehemu ya milango mitatu, San Lorenzo, Santo Stefano na Wainjilisti wamechongwa kwa usaidizi. Baada ya kupita atriamu ya kwanza, kuna vibao vya ukumbusho kwa kumbukumbu ya kuwekwa wakfu kwa kanisa (1579), ya kuwekwa wakfu kwa San Gregorio Armeno na ziara ya Pius IX mnamo 1849.