Kaplnka San Severo zachováva jedinú prácu, ktorá zostala medzi mnohými, ktoré Raphael vykonal pre mesto Perugia. Je to freska zobrazujúca Trojicu a SS Maurus, Placidus, Benedikt mučeník a Ján mních, ktorú v roku 1505 objednal biskup Troilo Baglioni. Dielo, ktoré zostalo nedokončené Raphaelom, keď ho pápež Július II. zavolal do Ríma, dokončil-vtedajší Starý-Pietro Vannucci, Il Perugino, v roku 1521. SS Scholastica, Jerome a Ján evanjelista, Gregory Veľký, Boniface a Martha zobrazené na spodnej časti fresky sú mu pripisované