Zapravo, katedrala datira iz druge polovice 1000. godine, a izgrađena je na drevnim ostacima mesapskih, rimskih i ranokršćanskih sela. Također je pretrpjela brojne napade, više puta je rušena i obnavljana. Jedna epizoda iznad svih svakako je turska invazija 1480. godine, tijekom koje je ispisana jedna od najtužnijih stranica za grad: naime, unutar katedrale su masakrirani vjernici i pripadnici svećenstva koji su se unutar ovih zidina sklonili kako bi pobjegli od ' napad. Kršćansko mjesto je opljačkano i korišteno kao džamija, a umjetničko blago u njemu je uništeno, sve dok crkvu i cijeli grad nisu oslobodili Aragonci.Iz tih razloga Katedrala ima originalan stil: pročelje ima oblik kolibe, s velikom središnjom rozeticom, obogaćenom tankim gotičkim nizom ispresijecanim sa 16 konvergentnih zraka; dva su portala, jedan veliki u baroknom stilu, praćen s dva stupa koji podupiru arhitrav, i jedan niži koji je dodan kasnije i nalazi se s lijeve strane. To su elementi koje žele razni nadbiskupi koji su tijekom godina slijedili jedan drugoga pod zapovjedništvom Otrantske biskupije.Građevina ima tlocrt bazilike, a njezina unutrašnjost nudi arhitektonski i umjetnički spektakl. Odmah dolazi do izražaja klasična podjela na tri broda, ograničena redovima od pet korintskih stupova koji su međusobno povezani velikim lukovima s dvostrukim lunama. Središnju lađu i prezbiterij krasi prekrasan strop s drvenim lakunarima sa zlatnim detaljima. S druge strane, središnje lađe obogaćene su slikama i šest oltara posvećenih kršćanskim sakramentima i simbolima.Na kraju desne lađe nalazi se jedna od najdirljivijih uspomena na katedralu: kapela mučenika. To je dio crkve posvećen uspomeni na povijesno istrebljenje Otrantskih mučenika, odnosno 800 kršćanskih žitelja koje su 1480. godine Turci masakrirali jer se nisu htjeli odreći svoje vjere. Pogled na izložene ostatke, kosti i 'kamen mučeništva' na kojem su se vjerojatno dogodila ubojstva apsolutno oduzima dah i vraća nas na bol koju vjerski ratovi uzrokuju i danas.Pravi dragulj unutrašnjosti Katedrale je podni mozaik: umjetničko djelo apsolutne vrijednosti, zapanjujuće ljepote i velikog značaja. Remek-djelo koje je stvorio redovnik Pantaleone i koje je dovršeno 1164. godine zapravo prikazuje stablo života i odlomke iz Starog zavjeta koji govore o putovanju koje čovjek prolazi kako bi se riješio grijeha i potražio vječno spasenje. 'Glumci' mozaika su dakle Adam i Eva, ali i drugi likovi i brojne životinje, svaka dakako sa svojim simboličkim opterećenjem. Djelo krasi svojom veličanstvenošću lađe i prezbiterij.Mnogo starija je kripta, izgrađena u 11. stoljeću, koja predstavlja jedan od arhitektonski najzanimljivijih dijelova cijele građevine. To je zapravo najstarija od apulijskih kripti, a njezina je važnost također zbog velike veličine. Poseban oblik kripte, podijeljene na 5 lađa i 72 između stupova i stupova navodi na zaključak da se radi o svojevrsnoj minijaturi Mesquite iz Cordobe i Plave džamije iz Konstantinopola, što je dodatna potvrda kulturne mješavine koju Otranto ima. uvijek bio protagonist. Kulturna mješavina, susretanje naroda, spoj različitih umjetničkih stilova o čemu u podzemnoj kapeli svjedoči još jedan važan element: nevjerojatna raznolikost i heterogenost 42 stupa na kojima je sagrađena. Svaki od njih, naime, ima svoju kvalitetu i porijeklo mramora i granita, te različite kapitele u jonskom, korintskom, bizantskom i islamskom stilu. Nadalje, do kripte se može doći preko dva stubišta koja se nalaze unutar katedrale.