Katedralen är faktiskt från andra hälften av år 1000 och byggdes på de gamla resterna av messapiska, romerska och tidiga kristna byar. Den har också utsatts för många angrepp och har förstörts och återuppbyggts flera gånger. En episod som är viktigast är säkert den turkiska invasionen 1480, under vilken en av de sorgligaste sidorna skrevs för staden: inne i katedralen massakrerades nämligen de troende och medlemmar av prästerskapet som tog sin tillflykt innanför murarna för att undkomma attacken. Den kristna platsen länsades och förvandlades till en moské, och de konstskatter som den innehöll förstördes, tills kyrkan och hela staden befriades av aragonierna.Av dessa skäl har katedralen en originell stil: fasaden har en gavelform, med ett stort centralt rosettfönster, berikat av tunna gotiska tracerier som korsas av 16 konvergerande strålar; det finns två portaler, en större i barockstil, eskorterad av två kolonner som stöder architraven, och en lägre som tillkommit senare och ligger på vänster sida. Dessa element har beställts av de olika ärkebiskopar som under årens lopp har avlöst varandra vid rodret för Otranto stift.Byggnaden har en basilikaplan och dess interiör är ett arkitektoniskt och konstnärligt spektakel. Den klassiska indelningen i tre skepp sticker genast ut, avgränsad av rader av fem korintiska kolonner som är förbundna med varandra genom breda dubbla lunatbågar. Skåneskepp och korrum är prydda av det vackra lacunartaket i trä med förgyllda detaljer. De centrala mittgångarna berikas av målningar och sex altare som är tillägnade sakramenten och kristna symboler.I slutet av den högra gången finns ett av de mest rörande minnena i katedralen: Martyrernas kapell. Denna del av kyrkan är tillägnad minnet av den historiska utrotningen av Martyrerna i Otranto, de 800 kristna invånarna som massakrerades av turkarna 1480 för att de inte ville avsäga sig sin tro. När man tittar på de utställda kvarlevorna, benen och "martyrstenen" på vilken morden troligen ägde rum, blir man helt andfådd och får oss att tänka på den smärta som religionskrig fortfarande orsakar i dag.Den verkliga juvelen i katedralens interiör är golvmosaiken: ett konstverk av absolut värde, häpnadsväckande skönhet och stor betydelse. Mästerverket, som skapades av munken Pantaleone och färdigställdes 1164, föreställer i själva verket livets träd och de avsnitt i Gamla testamentet som berättar om den väg som människan tar för att vända sig från synden och söka evig frälsning. Mosaikens "aktörer" är alltså Adam och Eva, men också andra karaktärer och många djur, som alla naturligtvis har sin egen symboliska laddning. Verket förskönar skeppet och koret med sin egen storslagenhet.Mycket äldre är dock kryptan, som byggdes på 1000-talet och som är en av de arkitektoniskt mest intressanta delarna av hela byggnaden. Det är faktiskt den äldsta av de apuliska kryptorna, och dess betydelse beror också på dess avsevärda storlek. Kryptens speciella utformning, uppdelad i fem skepp och 72 kolonner och pelare, får en att dra slutsatsen att den är ett slags miniatyr av Mesquita i Cordova och Blå moskén i Konstantinopel, vilket ytterligare bekräftar den kulturella blandning som Otranto alltid har varit en huvudperson i. En kulturell blandning, ett möte mellan folk, en kombination av olika konstnärliga stilar, som i det underjordiska kapellet bevittnas av ett annat viktigt element: den otroliga mångfalden och heterogeniteten hos de 42 pelarna som den är byggd på. Var och en av dem har faktiskt sin egen kvalitet och sitt eget ursprung av marmor och granit, och olika kapitäl i jonisk, korintisk, bysantinsk och islamisk stil. Dessutom är kryptan tillgänglig via två trappor som ligger inne i katedralen.