Het klooster van San Domenico Maggiore, dat met de kerk een complex van grandioze proporties vormt, is het resultaat van een eeuwenlange gelaagdheid die begon in 1227 toen paus Gregorius IX een kleine groep dominicanen naar Napels stuurde die zich vestigden in het oude klooster van San Michele Arcangelo in Morfisa. Thomas van Aquino verbleef tussen 1272 en 1274 in het klooster en doceerde theologie in het Studium dat daar door Karel I van Anjou was opgericht. In 1289 werd begonnen met de renovatie van het klooster. De organisatie, die in de loop der eeuwen geleidelijk uitgroeide tot een insula die bijna vier keer zo groot was als het oude stadsraster en die door bezoekers in de loop der tijd werd vergeleken met een ware stad in een stad, bereikte haar hoogtepunt na de werkzaamheden die vanaf 1669 werden bevorderd door prior Tommaso Ruffo van de hertogen van Bagnara.Prior Ruffo, die een groot deel van zijn persoonlijk patrimonium aan de werkzaamheden besteedde, wilde bepaalde vertrekken die verband hielden met de eeuwenoude geschiedenis van het complex, zoals de cel van Sint-Thomas, veiligstellen. Het resultaat van de werkzaamheden die de hele 17e eeuw duurden, was een gebouw van majestueuze afmetingen, verdeeld in drie armen: de Thomasslaapzaal, het noviciaat en de Masterslaapzaal, gerangschikt rond een open ruimte die als tuin was bestemd. Naast de Thomasslaapzaal lagen op de eerste verdieping de refter, de kapittelzaal en de bibliotheek. De architecten Bonaventura Presti, Francesco Antonio Picchiatti en Luigi Nauclerio namen om beurten deel aan deze monumentale onderneming. Tegenwoordig is het klooster opgedeeld in verschillende ruimtes: een deel wordt gebruikt door de Dominicanen, een deel op kloosterniveau wordt ingenomen door het Virtus gymnasium, een ander deel wordt op drie niveaus ingenomen door het schoolinstituut Casanova, en tenslotte is het belangrijkste deel, waar tot in de jaren negentig de klaslokalen van het voormalige Hof van Assisen waren ondergebracht, het onderwerp van de huidige restauratiewerkzaamheden.De restauratie van deze grote ruimten, waarin zowel de veiligheidscellen als de zittingszalen waren ondergebracht, met als gevolg het creëren van tussenverdiepingen, valse plafonds en ongerijmde bouwelementen, had tot doel de oorspronkelijke architectonische en ruimtelijke kenmerken te reconstrueren en de verbindingen tussen de zalen en hun typologische kenmerken te herstellen. Een belangrijk deel van de ingreep betrof de decoratieve "huid" van deze monumentale ruimten met de restauratie van de overgebleven picturale cycli, het laat 17e-eeuwse stucwerk en de Sint-Thomascel, die geheel in de jaren 1720 is gedecoreerd, alsmede talrijke meubelstukken, waaronder de liturgische machine voor de Quarantijnen, een complex organisme dat een van de aantrekkelijkste punten van de toekomstige museale organisatie van deze ruimten kan vormen. Bij het project, dat een grote oppervlakte van ongeveer 7.000 vierkante meter besloeg, waarvan 4.000 vierkante meter van het voormalige Hof van Assisen, volledig gerestaureerd en opnieuw in gebruik genomen, en 3.000 vierkante meter van de vleugel van het Instituut A Casanova, uitsluitend geconsolideerd, was een grote werkgroep van de Directie van het Bouwkundig Erfgoed van Napels en zijn provincie betrokken, met de inbreng van de ervaring van gekwalificeerde externe adviseurs, gedurende een lange periode, onderbroken door twee opeenvolgende werkperioden vanaf 2000.Het eerste perceel, dat in 2000 begon en in 2002 werd afgerond, maakte deel uit van het programma Polis - Musea, dat door dezelfde Superintendency werd gepromoot voor de valorisatie van historische Napolitaanse gebouwen met medefinanciering van de Europese Gemeenschap in het kader van de EFRO-middelen van het project "Globale subsidie Oudheidkundig Centrum van Napels". Het tweede perceel, waarmee in mei 2006 werd begonnen en dat in juli 2011 werd voltooid, werd gefinancierd dankzij wet nr. 400, art. 1 "Interventies op het culturele erfgoed" van 20.12.2000, ingevolge de kaderprogrammaovereenkomst tussen het ministerie van Cultureel Erfgoed en Activiteiten en de regio Campania.Het klooster werd in mei 2012 heropend voor het publiek dankzij de gezamenlijke inzet van lokale en centrale instellingen.