Kostel San Matteo, který Doria postavila jako vlastní šlechtickou kapli, má výhled na Malé Náměstí Piazza San Matteo v Janově.S šestnáctého století, rekonstrukce, interiér, s třemi náboji, má téměř úplně ztratil svůj původní gotický charakter, z nichž pouze čtyři ogivální oblouky na spodní části kupole zůstane, podporovaný dvěma pilíři směrem k presbytáři a dva sloupce směrem na Náves. Centrální loď je oddělena od bočních sloupů. Sbor, oltář s trofejí, dvě kazatelny a urny presbytáře jsou připisovány Silvio Cosini a Giovanni Angelo Montorsoli. Všechny přítomné dekorace lze připsat rekonstrukci ze šestnáctého století. V klenbě lodi jsou zázrak etiopského draka Luca Cambiaso a povolání San Matteo Giovanni Battista Castello. Na oltáři na pravé straně hlavní je umístěn obraz Svaté Rodiny s St. Anne, Bernardo Castello, od šestnáctého století; na levé straně, Kristus mezi Světci a dárci Andrea Semino. Na stěnách presbytáře jsou mramorové oblouky Svatých Pelagius a Maximus, patroni Novigrad, Istrie, jejichž ostatky by byly přepravovány do Janova Gaspare Spinola v roce 1381. Pod vysokým oltářem je zachován meč patřící "otci vlasti" Andrea Doria, který mu byl dán podle tradice papeže Pavla III. Ve výklenku V lodi je Ukládání Ježíše do hrobu, polychromované dřevěné plastiky Anton Maria Maragliano, zatímco sochy v nikách apsidy (Milost, inspirovaný michelangelo, David, Jeremiáš, Jan Křtitel, a St. Andrew) jsou dílo Montorsoli, který také v kryptě pod sboru, s časem, ve zlacené štuky, které je přístupné po mramorové schodiště, která se nachází hrobka Andrea Doria, také práce jednoho umělce.
