Toute visite sur l'île de Palawan serait incomplète sans passer un peu de temps à El Nido. Le nom vient de l'espagnol pour "Le Nid" et c'est une ville qui se trouve à la porte de l'archipel de Bacuit, à l'extrémité nord de l'île. C'est là que se trouve un paysage vraiment spectaculaire, tant au-dessus qu'en dessous de la mer. Elle forme le parc de la réserve marine d'El Nido avec des espèces menacées telles que la palourde géante. Des cacatoès des Philippines ont également été réintroduits récemment. Le parc marin voisin du récif de Tubbataha, créé en 1993, est lui aussi incroyable. D'une superficie de 332 kilomètres carrés, il comprend des récifs nord et sud (atolls) et divers îlots. L'îlot nord est un important lieu de reproduction pour les oiseaux et les tortues et comprend un récif corallien vierge et un mur vertical de 100 mètres. Il existe également plusieurs autres îles et lagons coralliens.