La bibliothèque de Vallombrosa a déjà commencé à se former dans la communauté bénédictine naissante depuis sa fondation vers 1036, pour l'usage et la formation des moines. Remarquable par le nombre de codices et la présence des auteurs, la collection n'a cessé de s'accroître à la Renaissance et plus tard, à tel point que de nouvelles salles ont dû être construites pour contenir tout le patrimoine livresque réellement immense, comme en témoigne un inventaire-catalogue établi à la fin du XVIe siècle et aujourd'hui conservé dans le codex Vat. Lat. Avec la suppression napoléonienne de 1810, toutes les collections de Vallombrosa ont été saisies par l'État français, ce qui a entraîné une dispersion du patrimoine : la plupart des codices sont aujourd'hui conservés à la Biblioteca Medicea Laurenziana, à la Biblioteca Nazionale di Firenze et dans d'autres bibliothèques florentines, italiennes et étrangères. Avec le retour des moines à Vallombrosa en 1817, la reconstruction de la bibliothèque a été organisée et elle a ensuite été confisquée par l'État italien avec la suppression de 1866. La bibliothèque actuelle a été créée avec le nouvel établissement de la communauté monastique de Vallombrosa en 1949 et a retrouvé toute son ancienne splendeur grâce surtout au père Don Pierdamiano Spotorno, qui l'a soignée et enrichie de 1957 à 2015 avec beaucoup d'amour et de sagesse et avec une culture profonde.
La salle qui l'abrite a été construite dans les années 1587-89 et les rayonnages actuels datent de la première moitié du XIXe siècle.