La Cripta de Sant Magne va ser construït pel bisbe Pietro da Salerno al mateix temps que la catedral entre 1072 i 1104. Es va publicar com un tresor per a la preservació de tots els que d'una catedral, la de més sagrat: les relíquies dels Sants. L'habitació disposa de tres naus amb respecte a les de la part superior de l'església i tres absis. Les dotze columnes identificar Vint-i-Una Vegades que, amb les seves respectives parets estan decorades amb un cicle pictòric de bellesa excepcional que explica la història de la Salvació de l'home, des de la seva creació fins a la fi dels temps. Els frescos són atribuïdes a tres tallers de anònima artistes coneguts com a primer Mestre d'Anagni o Màster de les traduccions, Segon Mestre d'Anagni o Màster Ornatist i Tercer de Mestre d'Anagni. Per estilística i raons històriques els frescos de la Cripta es situa entre el final del segle XII i la primera meitat del segle XIII.
